计算化学公社

标题: Linux版本的gauss计算正常结束后,chk文件无法转换成fchk [打印本页]

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ichinose    时间: 2020-10-24 17:52
标题: Linux版本的gauss计算正常结束后,chk文件无法转换成fchk
量化新手一枚,碰到一个无法解决的问题,在Linux里面计算正常结束后,想把chk文件转换成fchk却一直出现如下报错。Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
Segmentation fault (core dumped)

也尝试了网上说的各种方法都没有用,求各位大神帮忙解答一下谢谢了!!(检查了chk文件是没有问题的。把输入文件在Windows下计算,得到的chk文件可以转换成fchk,就是在Linux里面不行)
(, 下载次数 Times of downloads: 37)




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ichinose    时间: 2020-10-24 17:55
然后也计算了其他输入文件,但是chk都无法转换成fchk,不知道哪里出了问题
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hxd_yi    时间: 2020-10-24 18:41
在linux下算的chk文件,应该也在linux下转成fchk。不能跨系统,不能跨版本。
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ichinose    时间: 2020-10-24 18:48
hxd_yi 发表于 2020-10-24 18:41
在linux下算的chk文件,应该也在linux下转成fchk。不能跨系统,不能跨版本。

大佬你好,我是在Linux下转换的,也没有跨版本,不知道是不是安装时formchk模块出了问题?
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sobereva    时间: 2020-10-25 06:48
你都没转换成功,何以下结论“检查了chk文件是没有问题的”,你至多只能是检查了输入和输出文件是没有问题的

如果你确信用的formchk子程序直接对应于产生这个chk文件的Gaussian,重算一遍,还不行就换个Gaussian版本再试
发帖的时候别自行手动写[新手求助]这种标签,给你去掉了,以后注意。

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ichinose    时间: 2020-11-5 13:52
sobereva 发表于 2020-10-25 06:48
你都没转换成功,何以下结论“检查了chk文件是没有问题的”,你至多只能是检查了输入和输出文件是没有问题 ...

谢谢sob大神的提醒和回复!抱歉最近才看到帖子,我重装了gaussian之后就好了,可能是之前formchk这个子程序有问题。
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xxzj    时间: 2021-12-10 19:51
sobereva 发表于 2020-10-25 06:48
你都没转换成功,何以下结论“检查了chk文件是没有问题的”,你至多只能是检查了输入和输出文件是没有问题 ...

老师,在linx系统下使用高斯计算任务完成后,将chk转为fchk时遇见了下面的问题,想请问老师这种情况应该如何才能处理? (, 下载次数 Times of downloads: 11)

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abin    时间: 2021-12-10 20:19
xxzj 发表于 2021-12-10 19:51
老师,在linx系统下使用高斯计算任务完成后,将chk转为fchk时遇见了下面的问题,想请问老师这种情况应该 ...

白话文,
当前分配给你的内存不足。
看高斯手册,有描述。
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sobereva    时间: 2021-12-11 04:40
xxzj 发表于 2021-12-10 19:51
老师,在linx系统下使用高斯计算任务完成后,将chk转为fchk时遇见了下面的问题,想请问老师这种情况应该 ...

设置GAUSS_MEMDEF环境变量,指定比默认更大的内存可用量上限。下文提到了

巨大体系的范德华表面静电势图的快速绘制方法
http://sobereva.com/481http://bbs.keinsci.com/thread-13140-1-1.html
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hhxx    时间: 2023-6-20 14:59
我想借楼问一下,我是用vasp算的出来的.chk文件,是不是也需要在linx下才可以转,我在windos下转了一下出现了下面的错误





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