计算化学公社

标题: UFF力场适用性问题 [打印本页]

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孙宝刚    时间: 2020-10-26 10:47
标题: UFF力场适用性问题
  请问老师 用UFF力场自动生成的拓扑文件做了预模拟与预期不符(真空中,两个分子本来应该形成氢键但是模拟结果为互相远离)是不是说明UFF对这个体系不适用。

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Lacrimosa    时间: 2020-10-26 14:05
UFF普适性比较强但是精度比较差,不同的力场有不同的适用范围,你需要根据自己的体系去选取。也不排除其他可能,比如两个分子距离太远的情况
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sobereva    时间: 2020-10-26 14:22
一般的氢键主要本质是静电作用,对于普通的力场需要通过恰当的原子电荷才能表现。如果你的拓扑文件里没恰当或者根本没设电荷,肯定是描述不了氢键的。
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孙宝刚    时间: 2020-10-26 14:37
sobereva 发表于 2020-10-26 14:22
一般的氢键主要本质是静电作用,对于普通的力场需要通过恰当的原子电荷才能表现。如果你的拓扑文件里没恰当 ...

我用的mutifwn 计算的ADCH电荷,电荷应该没有问题。
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孙宝刚    时间: 2020-10-26 14:40
不好意思,网络卡,发了好几次。
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sobereva    时间: 2020-10-26 14:59
孙宝刚 发表于 2020-10-26 14:37
我用的mutifwn 计算的ADCH电荷,电荷应该没有问题。

这和模拟条件也有关,比如温度,温度高了自然就会飞了
先用低温模拟进行试验




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