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标题: 无机小分子(例如无机酸)这种模拟什么力场合适? [打印本页]

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努力向上的boy    时间: 2020-10-27 23:15
标题: 无机小分子(例如无机酸)这种模拟什么力场合适?
1、我想请教一下,无机小分子(例如无机酸)这种模拟什么力场合适?以及拓扑分子的建立有推荐的吗?之前试过用acpype生成gaff(有机小分子的)的,但是氢位置给的参数不太好。2,自己看了几篇文章都是无机酸的部分和有机物形成的物质,请问有纯无机酸推荐的文章吗?

作者
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sobereva    时间: 2020-10-28 09:22
用OBGMX弄基于UFF的拓扑文件先凑合试试,电荷用Multiwfn算的RESP电荷
作者
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努力向上的boy    时间: 2020-10-28 09:51
sobereva 发表于 2020-10-28 09:22
用OBGMX弄基于UFF的拓扑文件先凑合试试,电荷用Multiwfn算的RESP电荷

谢谢老师,uff力场和gaff,amber这样的力场兼容吗,可以一起用吗?
作者
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sobereva    时间: 2020-10-29 13:13
努力向上的boy 发表于 2020-10-28 09:51
谢谢老师,uff力场和gaff,amber这样的力场兼容吗,可以一起用吗?

不兼容
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努力向上的boy    时间: 2020-10-29 21:10
sobereva 发表于 2020-10-29 13:13
不兼容

那请问老师,有和amber,gaff兼容的无机酸的力场吗?




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