计算化学公社

标题: 请问VMD做径向分布函数时选项step代表什么 [打印本页]

作者
Author: 运气加持 时间: 2020-10-28 20:56
标题: 请问VMD做径向分布函数时选项step代表什么
请问VMD做径向分布函数选项step代表什么？不同的数值可以调控什么吗？第二张图里面是我尝试算的时候的提示，不清楚10 frames的意思是什么。另外XDATCAR转化为ZDATCAR.pdb文件（VMD可读），这个XDATCAR里面有10000步，这和step的设定有关系吗？谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-29 12:22
每隔多少帧统计一次。指定帧号范围内所有帧都纳入考虑就写1

作者
Author: 运气加持 时间: 2020-10-29 18:18

sobereva 发表于 2020-10-29 12:22
每隔多少帧统计一次。指定帧号范围内所有帧都纳入考虑就写1

明白了，谢谢老师

作者
Author: huisang 时间: 2021-12-10 17:51

sobereva 发表于 2020-10-29 12:22
每隔多少帧统计一次。指定帧号范围内所有帧都纳入考虑就写1

老师您好,请问在Vmd中计算一个超晶胞的RDF时，Selection选择'all'，这样计算出来的RDF是对每两个原子间的RDF进行平均吗？（目的是验证在分子动力学弛豫后的超晶胞的RDF与实验值是否一致）
感谢老师的解答

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-11 04:42

huisang 发表于 2021-12-10 17:51
老师您好,请问在Vmd中计算一个超晶胞的RDF时，Selection选择'all'，这样计算出来的RDF是对每两个原子间的 ...

是

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