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标题: 求助:分子模拟中由MSD得到的自扩散系数D,与菲克定律或爱因斯坦关系中D的关系 [打印本页]

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jimulation    时间: 2020-10-29 20:04
标题: 求助:分子模拟中由MSD得到的自扩散系数D,与菲克定律或爱因斯坦关系中D的关系
本帖最后由 jimulation 于 2020-10-30 14:31 编辑

从GROMACS等分子动力学模拟程序跑出来的轨迹,可以轻松地分析某种粒子的均方位移(MSD)曲线,并自动拟合得到粒子的自扩散系数D(=MSD/6t)。

另一方面,在宏观体系中有近似描述扩散作用的菲克定律(https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%8F%B2%E5%85%8B%E5%AE%9A%E5%BE%8B), (, 下载次数 Times of downloads: 40)    (, 下载次数 Times of downloads: 45)
也有描述布朗运动(https://zh.wikipedia.org/wiki/%E5%B8%83%E6%9C%97%E8%BF%90%E5%8A%A8)的爱因斯坦理论, (, 下载次数 Times of downloads: 50)
并进一步在爱因斯坦关系(https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%88%B1%E5%9B%A0%E6%96%AF%E5%9D%A6%E5%85%B3%E7%B3%BB)中给出了扩散系数D和可观测物理量(温度、粘度、粒子半径等)的关系。 (, 下载次数 Times of downloads: 31)


而在维基百科的‘自扩散’词条中,将自扩散和扩散系数这两个概念进行了区别。 (, 下载次数 Times of downloads: 52)



想请教大家的是,分子动力学得到的自扩散系数D,和上述菲克定律、爱因斯坦理论中的扩散系数D,是同一个含义吗,有无区别呢?






作者
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sobereva    时间: 2020-10-30 13:28
D就是指的爱因斯坦那个,本来那个拟合公式就是用的爱因斯坦关系
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jimulation    时间: 2020-10-30 16:13
sobereva 发表于 2020-10-30 13:28
D就是指的爱因斯坦那个,本来那个拟合公式就是用的爱因斯坦关系

谢谢Sob老师




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