计算化学公社

标题: 求助按照sob大神编译好的vasp，测试没问题，跑起来自己的5步就直接显示内存... [打印本页]

作者
Author: ZizhenZhou 时间: 2020-10-31 10:57
标题: 求助按照sob大神编译好的vasp，测试没问题，跑起来自己的5步就直接显示内存...
本帖最后由 ZizhenZhou 于 2020-11-2 05:03 编辑

抱歉抱歉，重新编辑了一下。
如题，编译的vasp5.4.4.
测试什么的都没问题，跑起来自己的直接显示内存不足。用的超算3个节点，每个20核。
以前从来没有遇到过这样的情况。
提交脚本如下：

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name="SrTiO3_6"

#SBATCH -p Mem128s

#SBATCH --mem=129000

#SBATCH -N 3

# If you only need a few cores disable this and instead use

#SBATCH --exclusive

#SBATCH -n 60

# SBATCH --ntasks-per-node=20

# How long will it run [[HH:]MM:]SS, use UNLIMITED for no

#SBATCH --time=UNLIMITED

echo "Working directory is:"

pwd

source /etc/profile

# Loads Gaussian application directory

export GAUSS_JOBID=$SLURM_JOB_ID

export GAUSS_USER=$SLURM_SUBMIT_DIR

export TSNET_PATH=$GAUSS_LEXEDIR

export g09error=""

export OMP_NUM_THREADS=1

echo -n "Master Process is on: "

hostname

echo -n "Machine details are: "

uname -a

echo "Local Working Directory: $TMPDIR"

# Main Program Run

date

time mpirun -n 60 /home/z5189670/vaspmake/vasp.5.4.4/bin/

date

echo "Finished job $GAUSS_JOBID"

更新一下，根据 ’http://bbs.keinsci.com/thread-16082-1-1.html‘
重新编译并添加soft-hpc之后正常运行。

但是遇到了第二天提交相同任务时候又一次报出内存超出。再一次安装soft-hpc之后解决，不清楚具体原因，想请问各位看法。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-10-31 12:27
这又不是画画。。。能先把颜色去掉么

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-31 17:58
发帖之后都自己不看么？这么五颜六色看着不累么？重新编辑帖子，便于他人阅读。

作者
Author: ZizhenZhou 时间: 2020-11-2 05:03

sobereva 发表于 2020-10-31 17:58
发帖之后都自己不看么？这么五颜六色看着不累么？重新编辑帖子，便于他人阅读。

抱歉抱歉，已经重新编辑

作者
Author: ZizhenZhou 时间: 2020-11-2 05:08

zjxitcc 发表于 2020-10-31 12:27
这又不是画画。。。能先把颜色去掉么

已重新编辑，真抱歉

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)