计算化学公社
标题:
Gromacs合并轨迹文件求助
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作者Author:
laide
时间:
2020-11-5 10:59
标题:
Gromacs合并轨迹文件求助
大佬们,本人是学习Gromacs的萌新,请问一下合并轨迹文件的意思是进行多次模拟之后把各个模拟结果的xtc文件提取一定的帧然后合并在一起吗?这样做的目的是不是增加采样量,还有就是合并的时候有没有一定的顺序或规则,是直接就用tajcat命令合并吗?
作者Author:
sobereva
时间:
2020-11-5 23:14
看具体是什么目的
诸如原本10ns的轨迹,你分为5次跑2ns,并且每次都基于cpt文件精确延续之前的状态,合并之后就和一次跑10ns的轨迹相同
就是用trjcat合并,具体细节用gmx trjcat -h命令查看
作者Author:
laide
时间:
2020-11-6 07:56
sobereva 发表于 2020-11-5 23:14
看具体是什么目的
诸如原本10ns的轨迹,你分为5次跑2ns,并且每次都基于cpt文件精确延续之前的状态,合并 ...
哦哦,好的,谢谢sob大神
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