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标题: 求助：模拟离子在通道的传输过程中，经过nvt模拟后水分子分布不均匀 [打印本页]

作者
Author: 邱美佳 时间: 2020-11-6 10:54
标题: 求助：模拟离子在通道的传输过程中，经过nvt模拟后水分子分布不均匀
我想模拟离子在纳米通道中传输的体系，溶剂是水。我把纳米材料固定住，先跑了能量最小化后，直接跑nvt模拟。用的是恒定的298K的温度。为什么nvt跑了几十纳秒后水分子仍然分布很不均匀？我跑了30ns，感觉时间应该是足够的。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-15 09:17
这个图上看不清楚纳米通道的结构，也不知道灰球是什么，也不知道右边的真空区是怎么回事。这个结构看起来很奇怪

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