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标题: 请问一下nvt模拟的时候报错，没有加限制文件 [打印本页]

作者
Author: karme 时间: 2020-11-6 15:31
标题: 请问一下nvt模拟的时候报错，没有加限制文件
我跟着gromacs的教程，做到了nvt模拟这里。然后这里让我运行 gmxgrompp -f nvt.mdp -c em.gro -p topol.top -o nvt.tpr。
但是gromacs报错，说2018之后都要带有限制文件，要有-c的gro的文件，但是我看教程并没有-c的文件。
那个posre.itp文件，是对非氢原子施加位置限制力。难道是要将itp文件装成gro文件进行模拟吗
希望各位大神能教下我，不甚感激

作者
Author: karme 时间: 2020-11-6 15:34
不好意思，是没有-r的gro文件，希望各位大神能指教我

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-7 17:18
通常情况加上-r em.gro

你看的都是过时的教程

作者
Author: karme 时间: 2020-11-8 16:33

sobereva 发表于 2020-11-7 17:18
通常情况加上-r em.gro

你看的都是过时的教程

谢谢老师，加了之后就行

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