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标题: 使用MOPAC进行几何优化，添加MOZYME关键词，耗时反而增加了，为什么呢？ [打印本页]

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Author: 风起时想你 时间: 2020-11-7 11:24
标题: 使用MOPAC进行几何优化，添加MOZYME关键词，耗时反而增加了，为什么呢？
genmer生成4个水组成的10个团簇初始构型，采用molclus调用MOPAC进行几何优化。template.mop添加MOZYME，发现耗时反而增加了，这是为什么呢？

template.mop，内容为
PM6-DH+ precise
molecule
All coordinates are Cartesian
[GEOMETRY]

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-11-7 13:15
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-11-7 13:17 编辑

MOZYME是给大体系用的，4个水太小了，直接用DFT优化结构都行，半经验小菜一碟（由于你的体系过小，不建议加MOZYME，因为降低了精度）。几乎所有的低标度方法，在体系小的时候，耗时总是比传统方法要多的，有个时间拐点，体系大了才有优势。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-11-7 13:45

zjxitcc 发表于 2020-11-7 13:15
MOZYME是给大体系用的，4个水太小了，直接用DFT优化结构都行，半经验小菜一碟（由于你的体系过小，不建议加 ...

按照原文看精度降低倒是还好，但是小体系速度慢是真的

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-11-7 21:53

zjxitcc 发表于 2020-11-7 13:15
MOZYME是给大体系用的，4个水太小了，直接用DFT优化结构都行，半经验小菜一碟（由于你的体系过小，不建议加 ...

原来如此。随便构建的一个体系，其实就是想比较看看。

作者
Author: 风起时想你 时间: 2020-11-7 21:54

sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

感谢老师解答。

作者
Author: PC-coming 时间: 2022-1-7 10:11
本帖最后由 PC-coming 于 2022-1-7 10:12 编辑

sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

老师您好，请问下MOCLUS+MOPAC做初步优化气相离子团簇（几十个原子数）的结构时，需要设置自旋多重度吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-1-7 10:43

PC-coming 发表于 2022-1-7 10:11
老师您好，请问下MOCLUS+MOPAC做初步优化气相离子团簇（几十个原子数）的结构时，需要设置自旋多重度吗？

自旋多重度不为1的时候都得设

作者
Author: PC-coming 时间: 2022-1-7 14:43

sobereva 发表于 2022-1-7 10:43
自旋多重度不为1的时候都得设

好的，谢谢老师

作者
Author: 绊倒铁盒 时间: 2025-1-6 18:09

sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

老师我想问一下，如果优化200-300个原子的体系建议加上MOZYME吗，耗时会有明显缩短吗

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-7 01:20

绊倒铁盒发表于 2025-1-6 18:09
老师我想问一下，如果优化200-300个原子的体系建议加上MOZYME吗，耗时会有明显缩短吗

不建议。不会
这种大小的体系还远达不到MOZYME能带来额外好处的情况

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