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标题: 求助分子或自由基BDE计算 [打印本页]

作者
Author: shaserena 时间: 2020-11-9 10:13
标题: 求助分子或自由基BDE计算
本帖最后由 shaserena 于 2020-11-9 19:04 编辑

求助，本人论文中计算了若干反应路径。收到审稿意见如下，

When working with different C-centred radicals itwould be beneficial to reader to see relative stabilisation energies (RSE)and/or bond dissociation energies (BDE) for each calculated species. Thus, by comparing BDEs of different chemical species(CS) one could easily predict thermodynamics of the reaction. Please add a RSE/BDE scheme with all the CS present.

想请问分子或者自由基的键解离能是什么？应该怎么计算。

我看对一个化学反应来说键解离能是焓的差，比如A-B → A• + B•，BDE=H(A•)+H(B•)-H(A-B)。那对于其中的A-B，A•以及B•，这三种分子或自由基，他们的BDE又怎么计算呢？

这是我计算的两个反应

想求助如何应对审稿人问题。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法，BDE是对于键而言的，而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、O-H键的BDE都是不同的，所以不存在甲醇的BDE这个说法。
至于具体需要算哪些键的解离能才能对于你的问题起到说明作用，那取决于你研究的具体是什么化学过程。

作者
Author: shaserena 时间: 2020-11-9 17:20

wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法，BDE是对于键而言的，而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

多谢回复，您看是不是这个意思甲醇里的C-H键的BDE
BDE(H-CH2OH)=H(H)+H(CH2OH)-H(CH3OH)
甲醇里的C-O键的BDE
BDE(CH3-OH)=H(OH)+H(CH3)-H(CH3OH)

这样算对吗？（上面式子里自由基都没加点，网页编辑不会加

）

作者
Author: shaserena 时间: 2020-11-9 19:03

wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法，BDE是对于键而言的，而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

我重新编辑了问题，可否帮忙看一下，按照审稿人的要求我应该怎么做，或者给解释一下审稿人到底什么意思

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-10 02:04

shaserena 发表于 2020-11-9 17:20
多谢回复，您看是不是这个意思甲醇里的C-H键的BDE
BDE(H-CH2OH)=H(H)+H(CH2OH)-H(CH3OH)
...

对

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-11-10 08:25

shaserena 发表于 2020-11-9 19:03
我重新编辑了问题，可否帮忙看一下，按照审稿人的要求我应该怎么做，或者给解释一下审稿人到底什么意思

你的CS2到CS3的反应条件是什么？

作者
Author: shaserena 时间: 2020-11-10 10:04

sobereva 发表于 2020-11-10 02:04
对

多谢sob老师，想继续请教G3方法算出来的单点能，活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度高一些？有没有相关的文献之类的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-11-10 11:04

shaserena 发表于 2020-11-10 10:04
多谢sob老师，想继续请教G3方法算出来的单点能，活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度 ...

能高不少，但是计算量大。文献就看G3方法的原始文献就行

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-11 00:36

shaserena 发表于 2020-11-10 10:04
多谢sob老师，想继续请教G3方法算出来的单点能，活化能是否比b3lyp/6-311++g(d,p)构型优化得出的BDE精度 ...

G3完全过时了，如今毫无实用价值
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-1132-1-1.html
BDE不是高一些，而是有天壤之别

热力学组合方法算的是热力学量，不是算单点能的
另外，活化能是通过阿伦尼乌斯公式拟合的，不是量化直接算出来的，仔细看
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506（http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html）

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2023-11-16 22:23

wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:59
不存在分子或者自由基的BDE的说法，BDE是对于键而言的，而不是对于分子而言的。比如甲醇里的C-H键、C-O键、 ...

老师，请问对于环状分子开环反应，想要判断哪个键容易断是算BDE吧？可是只断一个键长产物也只有一个，那BDE公式是H开环后的分子减去H环状分子吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-17 21:30

嘤嘤嘤发表于 2023-11-16 15:23
老师，请问对于环状分子开环反应，想要判断哪个键容易断是算BDE吧？可是只断一个键长产物也只有一个，那B ...

按http://sobereva.com/522的方法算，虽然说的是氢键，但是不难推广到共价键

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2023-11-18 11:51

wzkchem5 发表于 2023-11-17 21:30
按http://sobereva.com/522的方法算，虽然说的是氢键，但是不难推广到共价键

好的，谢谢老师

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