计算化学公社

标题: 研究温度对蛋白(溶于水)的影响,如何设置不同温度 [打印本页]

作者
Author:
karme    时间: 2020-11-9 12:51
标题: 研究温度对蛋白(溶于水)的影响,如何设置不同温度
我想要研究温度对蛋白(蛋白溶于水)的影响,分别是25,40,80,120度
我想知道如何设定温度,是调整nvt文件中的参数吗,如何调整呢



作者
Author:
karme    时间: 2020-11-9 14:56
还有就是,我设定温度方法为v-rescale,对于同一个蛋白,tc-group怎么分。温度改变速率又应该怎么设定呢
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-10 02:08
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充


1 修改ref_t

2 先说清楚里体系都有什么物质。通常蛋白质一个控温组,抗衡离子和溶剂一个组

一般情况下,模拟一开始从0 K线性升温到实际模拟用的温度
作者
Author:
karme    时间: 2020-11-10 09:10
谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3