计算化学公社

标题: 关于电子密度的计算问题 [打印本页]

作者
Author:
clayer    时间: 2020-11-9 17:29
标题: 关于电子密度的计算问题
我想用激发态的电子密度(整体激发)来解释取代基效应对激发态能量的影响,于是选择用Elec-Hole来算,感觉非常好用,特别是有定量的Elec-Hole difference,与我的计算结果十分相符。可我的导师说这个方法太新,让我找一个经典的方法来佐证一下,请问有什么方法比较合适?另外,我个人觉得在算电子密度时应该加上density=current,可是加不加对于Elec-Hole difference都一样,那这一关键词到底是用来算什么的?

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-10 02:17
Multiwfn的hole-electron分析并不算多新,2013年就提出来了,之后都有上百篇使用hole-electron分析的文章发表,包括Nature Photonics等一堆影响力很高的刊物文章(今年我发的Carbon, 165, 461 (2020)也用了此方法,文章的补充材料里对此方法原理进行了简明扼要的介绍),根本不用担心会被质疑什么。没有能取代hole-electron分析价值的“经典”方法。

Multiwfn是基于分子轨道和组态系数计算的hole和electron,而density=current写不写只影响是否往chk/fch文件里记录激发态弛豫密度的密度矩阵,因此不会影响空穴-电子分析。

作者
Author:
clayer    时间: 2020-11-10 06:14
sobereva 发表于 2020-11-9 19:17
Multiwfn的hole-electron分析并不算多新,2013年就提出来了,之后都有上百篇使用hole-electron分析的文章发 ...

感谢Sob老师非常详细解答,我本来打算用3.21.3 Analyze charge-transfer based on density difference grid data算一下的
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-11 00:43
clayer 发表于 2020-11-10 06:14
感谢Sob老师非常详细解答,我本来打算用3.21.3 Analyze charge-transfer based on density difference gr ...

这明显没有空穴-电子分析好,因为此方法相当于是对空穴和电子重叠部分互相抵消后对应的密度差进行的分析,因此许多关于空穴和电子分布的信息已经消失了,空穴和电子也不再满足归一化。只有当用的理论方法是目前不被空穴-电子分析支持的方法如EOM-CCSD,才值得考虑用这个方法基于密度差来分析。
作者
Author:
clayer    时间: 2020-11-17 18:27
本帖最后由 clayer 于 2020-11-17 11:40 编辑
sobereva 发表于 2020-11-10 17:43
这明显没有空穴-电子分析好,因为此方法相当于是对空穴和电子重叠部分互相抵消后对应的密度差进行的分析 ...

我看了Sob老师发表在Carbon上的文章,以及用Elec-Hole来分析电荷分布的文章,但都只用isosurface来呈现分布,而我计算了各原子的net elec and hole值以及用IFCT计算了取代基对应主体分子在激发过程中的电子转移量,这些值对我非常重要,请问Sob老师知道有哪些引用的文章计算了这些数值吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-18 02:43
clayer 发表于 2020-11-17 18:27
我看了Sob老师发表在Carbon上的文章,以及用Elec-Hole来分析电荷分布的文章,但都只用isosurface来呈现分 ...

IFCT方法应当引用Multiwfn手册3.21.8节。如果你想再用实际应用支持一下的话,可以写“IFCT方法已被用于大量体系的研究,比如文献...”,引用一下Multiwfn用户使用IFCT分析发表的一些文章,比如(Google学术搜文章名可找到)

Experimental and DFT Studies on the FT-IR, NMR and UV-Vis Spectra of a Xanthene Derivative
Functionalized Pt(II) and Ir(III) NIR emitters and their covalent conjugates with polymer-based nanocarriers
A Rare Type of Rhenium(I) Diimine Complexes with Unsupported Coordinated Phosphine Oxide Ligands
Bicolor switching mechanism of multifunctional light-emitting molecular material in solid phase
Enhanced photoelectric and photocatalysis performances of quinacridone derivatives by forming D-π-A-A structure
Excited electronic states' properties of guanine quartet complexes with alkali metal cations
PtAu3 Cluster Complexes with Narrow-band Emission for Solution-Processed Organic Light Emitting Diodes
NIR emitting platinum pincer complexes based on the N^N^C ligand containing {benz[4,5]imidazo[1,2-a]pyrazin} aromatic system; synthesis, characterization and photophysical study
Theoretical insights on Type I-II photoreactions of potential Zn(II) polypyridyl photosensitizers for two-photon photodynamic therapy

作者
Author:
clayer    时间: 2020-11-18 16:07
sobereva 发表于 2020-11-17 19:43
IFCT方法应当引用Multiwfn手册3.21.8节。如果你想再用实际应用支持一下的话,可以写“IFCT方法已被用于大 ...

非常感谢Sob老师!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3