计算化学公社

标题: xtb优化结构，DFT算单点是否可靠？ [打印本页]

作者
Author: archer 时间: 2020-11-10 22:30
标题: xtb优化结构，DFT算单点是否可靠？
体系有500多原子，用GFN2优化过渡态，用高精度的DFT算单点能是否可靠。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-11-10 22:47
不可靠，xtb相对来说太糙了，最好简化模型，然后正常做DFT

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-11 00:21
看看此文末尾GFN-xTB优化的结构和DFT优化的结构的叠加图就知道GFN-xTB的结构有多糙了
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

作者
Author: GoldenBaby 时间: 2020-11-11 10:43
老实说，有些体系也不是完全不能用，有些时候跟DFT差距不是特别大；但是有时候得到的结果也是会让人大跌眼镜的

作者
Author: archer 时间: 2020-11-11 16:54

sobereva 发表于 2020-11-11 00:21
看看此文末尾GFN-xTB优化的结构和DFT优化的结构的叠加图就知道GFN-xTB的结构有多糙了
使用Molclus结合xtb ...

sob老师，您好！500个原子算DFT，基组至少要取到什么水平。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-11-11 16:57

archer 发表于 2020-11-11 16:54
sob老师，您好！500个原子算DFT，基组至少要取到什么水平。

B97-3c先看看，应该算得动，只做优化不做振动分析的话

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-11 22:21

archer 发表于 2020-11-11 16:54
sob老师，您好！500个原子算DFT，基组至少要取到什么水平。

对这种大小的体系不要楞算。这样大小的体系通常有足够油水在模型或者计算方式上进行恰当简化，诸如恰当截取、恰当用混合基组等等

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