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标题: MS建立的模型如何转化为除cvff力场以外的LAMMPS data文件? [打印本页]

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panki    时间: 2020-11-11 13:54
标题: MS建立的模型如何转化为除cvff力场以外的LAMMPS data文件?
本帖最后由 panki 于 2020-11-11 13:56 编辑

MS建立的模型中含有高分子聚合物和无机物,导出car文件后使用LAMMPS中的msi2lmp工具转化为data文件,试了几个力场文件,好像只有用cvff转换的data文件中有数据(但有缺失),其他的诸如OPLS转的data文件键角什么的都是0。但是我看到的文献有用OPLS和Reax的,请问使用msi2lmp能否实现除了cvff力场以外的data文件的转化,或者有什么其他途径进行导出data文件?


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江湖采花贼    时间: 2020-11-11 16:57
同求

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panki    时间: 2020-11-17 19:34
顶一下
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cx218    时间: 2020-11-19 10:40
我是将MS中的模型保存为car.格式然后利用MAPS分配力场导出的data文件,还可以用VMD导出。但是电荷部分都有一点问题,静等大神提供更好的方法。
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panki    时间: 2020-11-19 16:09
cx218 发表于 2020-11-19 10:40
我是将MS中的模型保存为car.格式然后利用MAPS分配力场导出的data文件,还可以用VMD导出。但是电荷部分都有 ...

请问用VMD导出的data文件如何在lammps中运行?我的data文件pair coeffs和bond coeffs等都没有,一直error
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cx218    时间: 2020-11-19 16:31
可以在输出命令后面加你需要的东西,因为我只需电荷 ,所以其他的我也没试过
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悟小空    时间: 2021-1-12 21:16
解决了吗,同求处理方法
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长缨乱舞    时间: 2022-2-16 11:07
楼主这么问题解决了吗?
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nontons    时间: 2022-2-16 11:17
可以研究一下Atomsk,网站教程很多
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hdmd    时间: 2022-2-20 01:39
msi2lmp真的不好用,学编程+packmol建模是目前lammps最好的选择
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lvzhiwei    时间: 2024-11-14 17:34
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