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标题: xtb跑md冻结原子出现问题 [打印本页]

作者
Author: CYQ@ 时间: 2020-11-14 22:19
标题: xtb跑md冻结原子出现问题
各位老师，我想请教一下。我弄了一个金属底板，我想将其原子冻住，然后在用xtb跑md，用命令xtb ***.xyz --input md.inp --omd --gnf 1 --alpb water跑，但是其金属原子一直在动，金属原子是无法冻住的吗？md.inp文件：
$md
temp= 400
time= 100.0
dump= 50.0
step= 1.0
hmass=1
shake=1
$fix
atoms:1-29
force constant=0
$end

这样金属原子是整个散开的
md.inp文件：
$md
temp= 400
time= 100.0
dump= 50.0
step= 1.0
hmass=1
shake=1
$constrain
atoms:1-29
$end

这样金属原子是小范围波动的

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-14 23:08
看清楚板块再发贴，学术求助帖不得发到“资源分享”子版块，这次给你移动了，下次直接删帖处理！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-14 23:11
xtb的MD目前不支持冻结（至少对之前我测试过的xtb 6.3 pre2而言）

作者
Author: CYQ@ 时间: 2020-11-15 09:51

sobereva 发表于 2020-11-14 23:11
xtb的MD目前不支持冻结（至少对之前我测试过的xtb 6.3 pre2而言）

好的，谢谢sob老师指导

作者
Author: fineren 时间: 2020-12-25 11:25
xtb做MD只能在固定温度下吗？我看了手册NVT系综就是一个固定温度。能不能像lammps那样设定一个起始温度和一个终了温度，计算升温的过程？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-2 20:26

fineren 发表于 2020-12-25 11:25
xtb做MD只能在固定温度下吗？我看了手册NVT系综就是一个固定温度。能不能像lammps那样设定一个起始温度和一 ...

目前版本不行

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