计算化学公社

标题: 求助：如何构建两个平行的DNA分子的体系？？ [打印本页]

作者
Author: 1900 时间: 2020-11-15 17:18
标题: 求助：如何构建两个平行的DNA分子的体系？？
目前，我目前生成了一个双链DNA分子，请问，怎么建立两个平行的DNA分子的体系？？

作者
Author: liuyuje714 时间: 2020-11-15 17:50
啥意思，复制粘贴平移？

作者
Author: 1900 时间: 2020-11-15 19:40

liuyuje714 发表于 2020-11-15 17:50
啥意思，复制粘贴平移？

是的。就是要建一个含有两个一样的DNA分子的体系，DNA分子之间轴平行且距离一定

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-15 23:30
在GaussView里手动调节就完了，需要精细控制的时候可以用VMD的几何变换命令。也可以试图用packmol，直接指定两个DNA分子出现的位置
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473（http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html）

作者
Author: 1900 时间: 2020-11-18 10:26

sobereva 发表于 2020-11-15 23:30
在GaussView里手动调节就完了，需要精细控制的时候可以用VMD的几何变换命令。也可以试图用packmol，直接指 ...

多谢sob老师！！！

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