计算化学公社

标题: UFF力场下小分子断裂问题求助 [打印本页]

作者
Author: 孙宝刚 时间: 2020-11-15 23:12
标题: UFF力场下小分子断裂问题求助
在真空中使用UFF力场进行模拟没有显著问题，放入甲苯中（甲苯与有机小分子都使用UFF力场）进行能量最小化后小分子断裂了这是怎么回事，该怎么解决。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-15 23:22
只可能是拓扑文件有问题，仔细反复检查

作者
Author: 孙宝刚 时间: 2020-11-16 22:24
本帖最后由孙宝刚于 2020-11-16 22:26 编辑

sobereva 发表于 2020-11-15 23:22
只可能是拓扑文件有问题，仔细反复检查

老师拓扑文件是UFF网站自动生成的，这个哪里会出问题呢。而且20个有机小分子有些断裂有些还是好的。请老师指点。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-17 02:21

孙宝刚发表于 2020-11-16 22:24
老师拓扑文件是UFF网站自动生成的，这个哪里会出问题呢。而且20个有机小分子有些断裂有些还是好的。请老 ...

自行检查[bonds]项，看看有没有漏的

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