计算化学公社

标题: Absolute values of the Duschinsky rotation matrix是什么软件作出的 [打印本页]

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-16 21:10
标题: Absolute values of the Duschinsky rotation matrix是什么软件作出的
请教文献作图，这是什么软件作出的，文章中提到用ADF程序计算出两态之间的Franck Condon因子，从中提取出连接两态的Duschinsky旋转矩阵(J)和位移向量(D)；
而这个图是两个态之间Duschinsky rotation matrix；谢谢

作者
Author: chemhou 时间: 2020-11-16 21:31
第一次听说ADF可以算FCF

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-16 21:37

chemhou 发表于 2020-11-16 21:31
第一次听说ADF可以算FCF

计算磷光发射

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-11-16 22:31
虽然不确定原图是什么软件作的，但是MATLAB可以作出类似的图，只不过默认配色区别会比较大。。。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-17 02:04
GaussView 6直接可以画Duschinsky矩阵，比如http://gaussian.com/gv6vibronic/

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-17 08:30

wzkchem5 发表于 2020-11-16 22:31
虽然不确定原图是什么软件作的，但是MATLAB可以作出类似的图，只不过默认配色区别会比较大。。。

好的谢谢

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-17 08:38

sobereva 发表于 2020-11-17 02:04
GaussView 6直接可以画Duschinsky矩阵，比如http://gaussian.com/gv6vibronic/

好的，谢谢老师，我想再请教下，我计算的文件是需要给出两态的Duschinsky旋转矩阵(J)和位移向量(D)吗？还有图中始态末态是Duschinsky Matrix 值吗？谢谢

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2020-11-17 09:12
ORCA的比较新的版本的ESD（激发态动力学）模块也可以打印出Duschinsky matrix

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-17 14:52

让你变成回忆发表于 2020-11-17 09:12
ORCA的比较新的版本的ESD（激发态动力学）模块也可以打印出Duschinsky matrix

谢谢，我已经看了，是计算ISC过程那部分给出的Duschinsky matrices吗，我想再问下有相关计算例子吗？谢谢指导

作者
Author: 让你变成回忆 时间: 2020-11-17 15:11
本帖最后由让你变成回忆于 2020-11-17 15:15 编辑

lijiaqi 发表于 2020-11-17 14:52
谢谢，我已经看了，是计算ISC过程那部分给出的Duschinsky matrices吗，我想再问下有相关计算例子吗？谢谢 ...

这部分内容我记得ORCA的手册上有例子，写得比较详细。但是由于算这个东西需要freq，而目前ORCA的freq貌似做得不太好，考虑到实际体系比较大，所以后来我就没关注了。可惜，要是能够给一定格式的freq文件让ORCA计算就好了。
另外，ORCA开发ESD这部分的作者也发过计算荧光、磷光速率的文章。（J. Chem. Theory Comput. 2019, 15, 1896−1904， J. Chem. Phys. 148, 034104 (2018)）但是该方法之前我也在论坛里咨询过sob老师，sob老师觉得通过微扰理论+SOCME的方式计算磷光速率还是不算精确。不过用ORCA来替代某些能够算这些速率的商业化软件我觉得还是可取的。

我大概记得貌似在ESD计算时如果采用默认的printlevel不会输出dushin矩阵，需要采用higher printlevel

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-17 17:03

让你变成回忆发表于 2020-11-17 15:11
这部分内容我记得ORCA的手册上有例子，写得比较详细。但是由于算这个东西需要freq，而目前ORCA的freq貌似 ...

好的谢谢我去看看，我用ADF测试有机小分子磷光速率也是与实验有两个数量级误差，目前也是没有解决办法，谢谢了

作者
Author: sobereva 时间: 2020-11-18 02:32

lijiaqi 发表于 2020-11-17 17:03
好的谢谢我去看看，我用ADF测试有机小分子磷光速率也是与实验有两个数量级误差，目前也是没有解决办法 ...

算磷光速率问题用Dalton基于响应理论算是最佳选择，我之前的测试里也是结果最好的

作者
Author: lijiaqi 时间: 2020-11-19 14:57

sobereva 发表于 2020-11-18 02:32
算磷光速率问题用Dalton基于响应理论算是最佳选择，我之前的测试里也是结果最好的

好的，谢谢老师，我去试下再和ADF对比一下

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