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标题: 求助:gromacs生成tpr报错 [打印本页]

作者
Author:
不明嚼栗子    时间: 2020-11-25 15:14
标题: 求助:gromacs生成tpr报错
老师们好,我在生成tpr文件时遇到报错:Removing all charge groups because cutoff-scheme=Verlet
Analysing residue names:
There are:    12        Ion residues
There are:   156      Other residues
Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups...
Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups...
Segmentation fault

想知道该如何解决这个问题?谢谢老师!

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-27 10:02
光从这上说不清楚,mdp不合理、拓扑文件有bug都有可能。一般碰见这种问题的思路是先尽量简化体系,反复对比,弄清楚什么因素导致的。但也有可能是当前gmx程序问题,如果输入文件检查不出毛病就换版本再试。




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