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标题: 请问GROMACS可以实现多力场联合使用吗？ [打印本页]

作者
Author: wo335979123 时间: 2020-12-1 14:21
标题: 请问GROMACS可以实现多力场联合使用吗？
请问GROMACS可以实现多力场联合使用吗？
在文献中看到The silica surfaces were modeled using CLAYFF forcefields . CO2 and hydrocarbon molecules were modeled using EPM2 and OPLS/AA force fields , respectively.A series of classical molecular dynamics simulations were performed using GROMACS 5.1.4.
看到文献中使用不同的力场做一个体系，请问怎样实现多个力场联合使用？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-1 15:50
可以

需注意1-4作用处理规则、LJ参数混合规则

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-12-1 17:08

sobereva 发表于 2020-12-1 15:50
可以

需注意1-4作用处理规则、LJ参数混合规则

老师您的意思是，在你模拟的体系中，不同的组分可以用不同的组分，只要1-4作用处理规则、LJ参数混合规则一样就可以，还是说只有上述的这些力场可以？？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-1 17:30

努力向上的boy 发表于 2020-12-1 17:08
老师您的意思是，在你模拟的体系中，不同的组分可以用不同的组分，只要1-4作用处理规则、LJ参数混合规则 ...

并没法说EPM2与OPLS-AA在原理上理想地兼容，既然有文献那么用，也得到过合理结果，自己用也就没事

作者
Author: raku 时间: 2024-12-3 22:28

sobereva 发表于 2020-12-1 17:30
并没法说EPM2与OPLS-AA在原理上理想地兼容，既然有文献那么用，也得到过合理结果，自己用也就没事

请教下Sob老师，有这种连用的itp/top文件可以参考参考吗

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