计算化学公社

标题: multiwfn计算原子碱性的问题 [打印本页]

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498746012    时间: 2020-12-1 14:27
标题: multiwfn计算原子碱性的问题
sob老师打扰了,如果我要算某个配合物中碳的碱性,需要在碳上加个质子优化一下配合物,然后用multiwfn计算一下,得到碳的total ESP,而不是ESP without contribution from nuclear charge of atom。是不是碳的total ESP越正,碳的碱性越强呀?

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sobereva    时间: 2020-12-1 15:47
可以直接用Multiwfn的局部定量分子表面分析考察碳的局部范德华表面上的静电势平均值,越负碱性越强
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://sobereva.com/159
或者计算碳的拟合静电势电荷

“碳的total ESP”指代不明,说清楚什么功能具体怎么算的。对于考察实际质子化状态的质子位置的静电势,显然不是考察碳的原子核位置的静电势。
作者
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498746012    时间: 2020-12-1 19:44
sobereva 发表于 2020-12-1 15:47
可以直接用Multiwfn的局部定量分子表面分析考察碳的局部范德华表面上的静电势平均值,越负碱性越强
使用Mu ...

碳的total ESP指的是进行multiwfn中选项1特定点属性计算,然后再算碳原子,屏幕会输出碳的total ESP
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sobereva    时间: 2020-12-2 07:39
498746012 发表于 2020-12-1 19:44
碳的total ESP指的是进行multiwfn中选项1特定点属性计算,然后再算碳原子,屏幕会输出碳的total ESP

显然碳原子核位置的静电势和酸性和碱性毫无直接联系,碳自己又不是要掉下来的原子,而且这又不体现碳对质子的吸引能力。要搞清楚基本原理
作者
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498746012    时间: 2020-12-2 09:53
sobereva 发表于 2020-12-2 07:39
显然碳原子核位置的静电势和酸性和碱性毫无直接联系,碳自己又不是要掉下来的原子,而且这又不体现碳对质 ...

谢谢sob老师,您辛苦啦




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