计算化学公社

标题: 怎样利用Gaussian确定自由基加合产物的连接位点呢？ [打印本页]

作者
Author: bannc 时间: 2020-12-4 09:29
标题: 怎样利用Gaussian确定自由基加合产物的连接位点呢？
如图（A）是某酚类化合物自由基（记作ArOH·），（B）是PTIO自由基（PTIO·）。已知A和B可以互相连接形成自由基加合产物（ArOH·+PTIO·=ArOH-PTIO），如何利用Gaussian确定其连接位点？

方案一：由于共轭作用，A中的单电子可能会离域到箭头所指的位置（不知道对不对），因此计算每一个箭头所指位置与B连接产物的焓变，焓变低的即是最合理结构。
方案二：直接算出所有可能位点的焓变进行比较。即只要不饱和的地方都视作可能位点。
方案三：由方案一确定可能位点后，算出过渡态，走IRC，计算能量变化。对于这个方案，是不是也要根据一中的不同位点算出不同的过渡态。

刚入门高斯，理论水平实在有限，见笑了。希望大神能够指导下，上述三种方案是否有可行的，或者有别的做法呢？万分感激。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-12-4 11:51
方案一箭头指的位置完全搞错了。仔细画出来自由基每一个可能共振到的位置，再判断一遍，确保共振式没有画错，然后按方案一初步筛选，去掉热力学非常不利的结构，再用方案三确定哪个在动力学上最有利。
不过从化学直观上讲，我觉得PTIO夺取右边的酚羟基氢的可能性比较大。实验上确定是加成了吗？还是只是观察到自由基消失了，不知道产物是一个分子还是两个分子？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-4 12:24
可以先把两个自由基优化出来，看看自旋密度分布（下文），有大概率是两个分子以单电子最富集的地方结合
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353（http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html）

作者
Author: bannc 时间: 2020-12-4 14:57
谢谢你们的指导，我大概明白了。图A箭头确实指错了，见笑。

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