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标题: Gromacs中如何构建菱形的盒子 [打印本页]

作者
Author:
ruanyang    时间: 2015-11-9 21:36
标题: Gromacs中如何构建菱形的盒子
请教一个问题,因为模拟工作的需要。我想在gromacs中构建一个菱形的盒子进行模拟。我知道editconf 命令可以指定盒子的形状,但是其选项中不存在 菱形。只有菱形十二面体或者是八面体,我不太清楚如果指定 -bt 为菱形十二面体的话,那个-box 后面的x,y,z 以及角度的值如何确定。请社友帮忙解释一下! 附上菱形的大致形状!

作者
Author:
XYwinne    时间: 2015-11-13 13:49
-bt triclinic -box 10 10 10 -angles 90 90 120
你是不是要用SiO2?
作者
Author:
ruanyang    时间: 2015-11-13 14:13
不是,谢谢您的回复。只是想试试菱形的盒子




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