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标题: 求助径向分布函数和配位数 [打印本页]

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Author: 小谁~ 时间: 2020-12-9 17:36
标题: 求助径向分布函数和配位数
我想请教大家一下，VMD求径向分布函数的窗口radial pair distribution function，selection1和selection2中的原子倒换顺序求出来的RDF是相同的，但是配位数却不同。配位数是径向分布函数积分得到的，如果RDF相同，那配位数也应该相同才对。这是为什么呢？谢谢大家！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-9 18:24
显然不是光积分rdf得到的

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作者
Author: 小谁~ 时间: 2020-12-9 19:33

sobereva 发表于 2020-12-9 18:24
显然不是光积分rdf得到的

是的，老师，我还是不太明白，为什么同一个rdf，会对应两个配位数呢？

作者
Author: 小谁~ 时间: 2020-12-9 19:54
分子动力学新手，还请大家多多指教

作者
Author: elpa 时间: 2020-12-9 23:10

小谁~ 发表于 2020-12-9 19:33
是的，老师，我还是不太明白，为什么同一个rdf，会对应两个配位数呢？

应该是积分前面乘的ρ不一样吧

作者
Author: 小谁~ 时间: 2020-12-10 14:58

elpa 发表于 2020-12-9 23:10
应该是积分前面乘的ρ不一样吧

如果想看O在H周围的分布情况（H是中心原子），求配位数的时候，带入的ρN是O的吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-10 19:46

小谁~ 发表于 2020-12-10 14:58
如果想看O在H周围的分布情况（H是中心原子），求配位数的时候，带入的ρN是O的吗？

显然是

作者
Author: 小谁~ 时间: 2020-12-11 11:21

sobereva 发表于 2020-12-10 19:46
显然是

好的好的！谢谢sob老师！

作者
Author: Jasmine123 时间: 2024-12-29 18:19
老师请问我是两种情况下的RDF不同，但是计算出的配位数相同，都采用的是NVT系综，并且两种情况的模拟体系完全相同，这也是因为密度导致的吗

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