计算化学公社

标题: 七元环中间体找不到,总是容易跑偏 [打印本页]

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朽木可自雕    时间: 2020-12-12 21:35
标题: 七元环中间体找不到,总是容易跑偏
第一次发求助帖,有什么不对的地方请老师指出
我的问题是这样的:七元环中间体找不到,起始结构中的双键总是容易旋转,使得优化的最终结构类似六元环

我的计算过程是这样的:
    1、对下图1中的序号为15,16,19的原子进行固定优化,得到了固定优化的结果(图2)
    2、将图2的结构保存为gjf文件,放开固定优化进行全优化,却得到了如图3所示的结构,这个结构类似六元环

但是我对另外一个结构进行优化,这个结构是原先分子中的17号碳上的甲基连到了19号碳上,却能轻而易举的得到七元环(在附件里,twoa3.log)。

问题是:
1、为什么两个相似的结构一个得不到七元环(是因为不存在这样的极小点吗?),而另一个很容易得到七元环
2、如果存在问题1括号里的极小点,如何得到它?

附件里,twoa4.log是跑偏了的结构,twoa4.log是可以得到七元环的结构(甲基连在19号碳上)


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                     图1



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                     图2


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              图3


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wzkchem5    时间: 2020-12-12 21:54
对15-17键长做一个柔性扫描就行了,如果不存在7元环中间体,可以用这个扫描图证明不存在;如果存在7元环中间体,从这个图上可以看出来在哪。
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Kikyou    时间: 2020-12-14 08:43
试试改下中心金属原子的自旋?
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朽木可自雕    时间: 2020-12-14 15:28
wzkchem5 发表于 2020-12-12 21:54
对15-17键长做一个柔性扫描就行了,如果不存在7元环中间体,可以用这个扫描图证明不存在;如果存在7元环中 ...

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老师,已经扫描了,15 -17键长从3.52936以-0.1为长度减到了1.82936(15 17 S  17 -0.1),在六元环那里有个最低点。

这样子能证明不存在七元环中间体吗?

作者
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wzkchem5    时间: 2020-12-14 15:49
朽木可自雕 发表于 2020-12-14 15:28
老师,已经扫描了,15 -17键长从3.52936以-0.1为长度减到了1.82936(15 17 S  17 -0.1),在六元环那里 ...

你改变甲基位置优化出来的七元环中间体,这个键长到3.52936埃了吗?如果没到,那么可以




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