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标题: 请问在GMX中计算相互作用能时的单位问题 [打印本页]

作者
Author: 向往阳光 时间: 2020-12-13 14:44
标题: 请问在GMX中计算相互作用能时的单位问题
比如说我现在有1000个水的盒子，跑完之后用energy抽出potential，单位是KJ/mol，这是否意味着给出的结果已经换算成了每摩尔水？但假如跑2000个水分子的轨迹，再提取出potential，得到的结果又与1000个水的结果不同。那么KJ/mol这个单位的含义是什么呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-14 01:02
给的是每摩尔当前体系的量。获得每摩尔单分子的值应当加上-nmol [盒子内分子数]

作者
Author: 向往阳光 时间: 2020-12-15 16:29

sobereva 发表于 2020-12-14 01:02
给的是每摩尔当前体系的量。获得每摩尔单分子的值应当加上-nmol [盒子内分子数]

哦谢谢sob老师

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