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标题: 如何确定CHARMM力场氧化石墨烯中官能团力学参数和电荷? [打印本页]

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libin093    时间: 2020-12-13 22:59
标题: 如何确定CHARMM力场氧化石墨烯中官能团力学参数和电荷?
请教社长和各位老师,我在做氧化石墨烯时,只在文献里查到了官能团OPLSAA力场的相关参数和电荷,但由于我需要采用CHARMM力场,该如何做呢?
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sobereva    时间: 2020-12-14 01:00
做这个有什么必要基于CHARMM力场?
是我的话,会基于GAFF做,拿Multiwfn算RESP电荷就完了
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DwyaneWan    时间: 2020-12-22 18:07
请问同学你氧化石墨烯的拓扑的charmm力场后来如何生成的呢?谢谢啦
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Lacrimosa    时间: 2020-12-22 19:07
sobereva 发表于 2020-12-14 01:00
做这个有什么必要基于CHARMM力场?
是我的话,会基于GAFF做,拿Multiwfn算RESP电荷就完了

请教老师一下,Amber和GAFF力场因为原本原子电荷就是用的RESP方法,所以当使用RESP和RESP2电荷的时候会有更好的结果。如果是对于其他力场诸如Charmm36、gromos、opls等,由于LJ参数不同,RESP电荷是否还同样适用就需要进一步测试了吧?
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sobereva    时间: 2020-12-23 03:30
Lacrimosa 发表于 2020-12-22 19:07
请教老师一下,Amber和GAFF力场因为原本原子电荷就是用的RESP方法,所以当使用RESP和RESP2电荷的时候会有 ...

从原子电荷与LJ参数的耦合层面上来看,是这样,涉及到误差抵消问题
但如果光从对静电作用的表现来看,原理上RESP/RESP2电荷是最合理的
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CruiseBend    时间: 2020-12-23 15:12
gmx石墨烯计算能交流一下吗?QQ:1025656536
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Murphy163    时间: 2021-3-17 21:08
你好,请问你有找到氧化石墨烯OPLSAA力场下键,键角和二面角的力常数吗,能够把相关论文分享一下吗,谢谢了!
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行行真的行    时间: 2021-3-24 10:12
Murphy163 发表于 2021-3-17 21:08
你好,请问你有找到氧化石墨烯OPLSAA力场下键,键角和二面角的力常数吗,能够把相关论文分享一下吗,谢谢了 ...

10.1016/j.desal.2017.08.013




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