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标题: gaussian中如何准确施加电场方向 [打印本页]

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小蜗    时间: 2020-12-15 12:35
标题: gaussian中如何准确施加电场方向
各位老师好~最近在gaussian中遇到了点问题,我希望在gaussian中沿着分子链加电场,但是不太会,而gaussian中的xyz轴是不沿着我的分子链的~想问一下有没有对电场方向的精确控制的办法,使电场沿着分子链或键的方向。谢谢各位老师~

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sobereva    时间: 2020-12-16 02:03
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,不要自己手写【求助】这种标签,给你去掉了

用field=read然后自己写电场矢量,或者按此文先让特定两个原子平行于某个笛卡尔轴
让指定化学键平行于笛卡尔坐标轴的方法
http://sobereva.com/177
作者
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小蜗    时间: 2020-12-17 09:52
sobereva 发表于 2020-12-16 02:03
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,不要自己手写【求助】这种标签,给你去掉了

用fie ...

哇~谢谢老师~以后我一定注意~
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小蜗    时间: 2020-12-18 09:24
sobereva 发表于 2020-12-16 02:03
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,不要自己手写【求助】这种标签,给你去掉了

用fie ...

sob老师 我的转化出了问题,用vmd转化为坐标文件后,重新把坐标写到gif文件中,结果该成键的地方没有键,不该成键的地方成键了。(我咋传不上去图片)这是我的gif文件 不知道是哪里出了问题。。。
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0 1
C                  1.04477611    0.26119403    0.00000000
C                      -1.955            0.3836              0.9229
C                      -2.8983           -0.5795              1.2743
C                      -4.2317           -0.0686              1.2061
C                      -4.3074            1.2481              0.8169
S                      -2.7351            1.9098              0.5349
H                      -5.1112           -0.6729              1.4361
H                      -5.1901            1.8698              0.6868
C                      -2.5934           -2.0256              1.5879
H                      -1.7593           -2.1036              2.3045
H                      -3.4696           -2.4683              2.0919
C                      -2.2544           -2.8528              0.3323
H                      -3.0948           -2.7838       -0.3818
H                      -1.3842           -2.3963             -0.1717
C                      -1.9577           -4.3251              0.642
H                      -2.8244           -4.7656              1.1673
H                      -1.108           -4.3846              1.3486
C                      -1.629           -5.1482             -0.6107
H                      -2.4938           -5.1227             -1.3006
H                      -0.7978           -4.6566             -1.1478
C                      -1.2464           -6.6122             -0.3359
H                      -0.9075           -7.0712             -1.281
H                      -0.374           -6.6361              0.3426
C                      -2.378           -7.4621              0.2548
H                      -2.0678           -8.512              0.374
H                      -2.6919           -7.0991              1.2459
H                      -3.2654           -7.4497             -0.4001
C                      -0.5051            0.3076              0.818
C                       0.3094            0.8448             -0.1647
S                       0.4821           -0.4618              2.0521
C                       1.7087            0.6351              0.0438
H                      -0.1016            1.357             -1.0368
C                       1.9447           -0.0686              1.2061
H                       2.9013           -0.393              1.6115
C                       2.7871            1.1234             -0.8903
H                       2.5857            0.7472             -1.9103
H                       3.7545            0.6877             -0.5877
C                       2.9128            2.6584             -0.9395
H                       1.9459            3.0945             -1.2489
H                       3.1041            3.0359              0.0807
C                       4.018            3.1404             -1.8868
H                       3.8337            2.7361             -2.9
H                       4.9872            2.7167             -1.5628
C                       4.1338            4.6675             -1.9655
H                       3.1676            5.0898             -2.2999
H                       4.3068            5.0741       -0.9513
C                       5.2479            5.1546             -2.901
H                       5.0788            4.7409             -3.9118
H                       6.2138            4.7393       -2.5608
C                       5.3453            6.6814             -2.9818
H                       6.1503            7.0013             -3.6616
H                       4.4036            7.1211             -3.3496
H                       5.5504            7.121             -1.9918

1 2 2.0 5 1.0 27 1.0
2 3 1.0 8 1.0
3 4 2.0 6 1.0
4 5 1.0 7 1.0
5
6
7
8 9 1.0 10 1.0 11 1.0
9
10
11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
12
13
14 15 1.0 16 1.0 17 1.0
15
16
17 18 1.0 19 1.0 20 1.0
18
19
20 21 1.0 22 1.0 23 1.0
21
22
23 24 1.0 25 1.0 26 1.0
24
25
26
27 28 2.0 29 1.0
28 30 1.0 31 1.0
29 32 1.0
30 32 2.0 34 1.0
31
32 33 1.0
33
34 35 1.0 36 1.0 37 1.0
35
36
37 38 1.0 39 1.0 40 1.0
38
39
40 41 1.0 42 1.0 43 1.0
41
42
43 44 1.0 45 1.0 46 1.0
44
45
46 47 1.0 48 1.0 49 1.0
47
48
49 50 1.0 51 1.0 52 1.0
50
51
52

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-12-19 09:21
小蜗 发表于 2020-12-18 09:24
sob老师 我的转化出了问题,用vmd转化为坐标文件后,重新把坐标写到gif文件中,结果该成键的地方没有键, ...

怎么上传图片在置顶的新社员必读贴里明确说了

gview怎么判断成键的这里说了
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
作者
Author:
xxzj    时间: 2021-5-7 14:43
sobereva 发表于 2020-12-16 02:03
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,不要自己手写【求助】这种标签,给你去掉了

用fie ...

老师,您好,我想给金属卟啉分子加电场,但是锌卟啉偶极矩为零,再加电场时需要x,y,z方向都加,还是按照一个方向加就可以,电场的大小应该如何选择?谢谢老师
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-5-8 02:15
xxzj 发表于 2021-5-7 14:43
老师,您好,我想给金属卟啉分子加电场,但是锌卟啉偶极矩为零,再加电场时需要x,y,z方向都加,还是按照 ...

取决于实际研究目的
作者
Author:
ciiangae    时间: 2021-7-21 16:17
sobereva 发表于 2021-5-8 02:15
取决于实际研究目的

老师,如果我电场加的是 -0.004, -0.004, -0.004, 那是不是说明我加的总电场方向是x,y,z的体对角线的逆方向,然后大小是(3*0.004^2)^0.5 a.u.
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-7-22 00:57
ciiangae 发表于 2021-7-21 16:17
老师,如果我电场加的是 -0.004, -0.004, -0.004, 那是不是说明我加的总电场方向是x,y,z的体对角线的 ...


作者
Author:
ciiangae    时间: 2021-7-28 11:23
sobereva 发表于 2021-7-22 00:57

谢谢
作者
Author:
zhouchen    时间: 2024-6-24 21:46
sobereva 发表于 2021-7-22 00:57

老师,请问这样加的是均匀电场吗?我看手册上写的是电偶极场。
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-6-24 23:51
zhouchen 发表于 2024-6-24 14:46
老师,请问这样加的是均匀电场吗?我看手册上写的是电偶极场。

均匀电场和电偶极场是一码事




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