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标题: 用MS建模之后。更改原子名称后,pdb文件报错 [打印本页]

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随风    时间: 2020-12-15 15:15
标题: 用MS建模之后。更改原子名称后,pdb文件报错
在MS中画好分子之后,导入VMD可以直接观看(图1)。将其上传至ATB,得到优化的pdb及itp文件,在VMD中依然可以打开(图2).当我把MS中的原子类型改为ATB中的原子类型时,VMD文件就打不开了(图3).谢谢各位老师了。
                       



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Lacrimosa    时间: 2020-12-15 17:14
打开pdb把connect的字段删掉
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Kangtor    时间: 2020-12-15 19:38
会不会是你改了原子类型时把格式弄错了?
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随风    时间: 2020-12-15 20:29
Kangtor 发表于 2020-12-15 19:38
会不会是你改了原子类型时把格式弄错了?

对,就是我改原子类型弄错了,谢谢老师
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随风    时间: 2020-12-15 20:29
Lacrimosa 发表于 2020-12-15 17:14
打开pdb把connect的字段删掉

谢谢老师了,我可能是原子类型不对。




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