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标题: 求助：g16A03不能使用大于12个核计算 [打印本页]
作者
Author: Novice    时间: 2020-12-15 15:26
标题: 求助：g16A03不能使用大于12个核计算
本帖最后由 Novice 于 2020-12-15 18:31 编辑

如题，我使用的电脑为双路Platinum 8173M（56核112线程） ，内存190G，系统为ubuntu18.04（非虚拟机），安装gaussian16 A03 AVX2后，最多只能使用12个核进行计算，一旦调用的核数较大，就会出现以下报错
  1. $ g16 ben.gjf
  2. Requested invalid number of cpus: 16
  3. Error: Requested invalid number of cpus.
  4.   /opt/g16/l1.exe() [0x7b1175]
  5.   /opt/g16/l1.exe() [0x7b1381]
  6.   /opt/g16/l1.exe() [0x7ac4b5]
  7. Aborted (core dumped)
复制代码
输入文件非常简单，如下：

%nprocshared=12
# opt b3lyp/tzvp em=gd3
……

有没有人遇到过类似情况，怎么解决的？


作者
Author: wzkchem5    时间: 2020-12-15 15:27
是不是license的限制？
作者
Author: Novice    时间: 2020-12-15 15:32
wzkchem5 发表于 2020-12-15 15:27
是不是license的限制？

应该不是，同样的文件复制到另一个电脑里面发现使用多少核都没有问题。
作者
Author: abin    时间: 2020-12-15 15:36
也没有说硬件配置，
也没有提，
是在虚拟机还是物理主机？
这怎么猜？
作者
Author: Novice    时间: 2020-12-15 15:39
abin 发表于 2020-12-15 15:36
也没有说硬件配置，
也没有提，
是在虚拟机还是物理主机？

已补充
作者
Author: zjxitcc    时间: 2020-12-15 18:40
Novice 发表于 2020-12-15 15:32
应该不是，同样的文件复制到另一个电脑里面发现使用多少核都没有问题。

“同样的文件”是同样的高斯安装包？
作者
Author: abin    时间: 2020-12-15 19:19
Novice 发表于 2020-12-15 15:39
已补充

如果你有root权限，
并且你的机器，可以对外访问网络，
我可以登录上去看看。

一两句说不清楚。

作者
Author: Novice    时间: 2020-12-15 19:31
zjxitcc 发表于 2020-12-15 18:40
“同样的文件”是同样的高斯安装包？

是的，就是同样的安装包复制过去，就修改下环境变量去运行。
作者
Author: winnerwill    时间: 2020-12-16 00:52
export OMP_THREAD_LIMIT=256

或者先echo ${OMP_THREAD_LIMIT} 看看
作者
Author: hlmkh    时间: 2020-12-16 12:46
Gaussian 16 has four versions below,
1. legacy for when none of the instruction sets listed below are available (no longer needed applicable any of the CHPC resources)
2 SSE4 - version for lonepeak nodes; 12 core nodes on ash
3 AVX - version for all tangent nodes; 16 and 20 core nodes on kingspeak and ash
4 AVX2 - version for 24 and 28 core nodes on kingspeak and ash; notchpeak nodes
作者
Author: Novice    时间: 2020-12-16 15:26
winnerwill 发表于 2020-12-16 00:52
export OMP_THREAD_LIMIT=256

或者先echo ${OMP_THREAD_LIMIT} 看看

谢谢，我配置xtb环境变量时，在不清楚OMP_THREAD_LIMIT是啥的情况下设了其为12. 按照此方法已经解决。多谢多谢。
作者
Author: Novice    时间: 2020-12-16 15:28
本帖最后由 Novice 于 2020-12-16 16:06 编辑
hlmkh 发表于 2020-12-16 12:46
Gaussian 16 has four versions below,
1. legacy for when none of the instruction sets listed below a ...

是AVX2版的，不过你给的这些我还是第一次见，AVX2好像不止能用28核吧？（我按照楼上方法已经解决问题了）
作者
Author: fdjkein_13    时间: 2023-12-7 15:23
出现类似的问题，也是xtb配置时设定了export OMP_THREAD_LIMIT=N，但不是g16出现问题，而是formchk出现问题，同目录下的cubegen、copychk等也报类似的错误。
后来将N改为小于等于服务器实际的核数即可正常执行。注意如果改为256超出服务器最大核数，依然不能正常使用，会报Requested invalid number of cpus: 256错误。



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