计算化学公社

标题: 编译gpu加速版gromacs在check时部分出错 [打印本页]

作者
Author: T_s_O_H_ 时间: 2020-12-16 03:34
标题: 编译gpu加速版gromacs在check时部分出错
首先说明一下硬软件信息，CPU Gold 5218R， GPU RTX 3080，系统CentOS 7.9，nvidia driver 455.32，cuda 11.1，用gcc 8编译。
前后编译了单精度GPU加速版本A，双精度版本B以及单精度无加速版本C，编译过程没有出现问题。对于B, C版本而言，make check全部测试通过，但是A版本在第56项测试 regressiontests/complex 过程中failed，输出结果如图所示。

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我想知道这个错误可能的原因（与显卡有关？），有没有什么解决的办法，以及会不会对后续的计算结果造成影响。谢谢各位！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-16 04:21
一般不会有影响。打开相应的含有具体错误信息的文件看看是怎么回事。
MD程序的这种类型问题有的是测试脚本本身有bug（如对各种实际情况的兼容性考虑不周），有时候是因为MD自身的混沌效应导致实际计算的与参考数据偏差超过阈值，但不能算是自己的结果有问题。

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