计算化学公社

标题: 求助gro文件里面的最后一行的具体含义 [打印本页]

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作者
Author: martinique    时间: 2020-12-17 01:01
标题: 求助gro文件里面的最后一行的具体含义
请教大神们，在gro文件里面的最后一行是盒子的大小，能否详细解释一下这些数值的具体含义，谢谢

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作者
Author: tjuptz    时间: 2020-12-17 09:14


官方在线文档里有http://manual.gromacs.org/curren ... le-formats.html#gro，三个方向的矢量box vectors (free format, space separated reals), values: v1(x) v2(y) v3(z) v1(y) v1(z) v2(x) v2(z) v3(x) v3(y), the last 6 values may be omitted (they will be set to zero). Gromacs only supports boxes with v1(y)=v1(z)=v2(z)=0.

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作者
Author: martinique    时间: 2020-12-17 18:43

tjuptz 发表于 2020-12-17 09:14
官方在线文档里有http://manual.gromacs.org/current/reference-manual/file-formats.html#gro，三个方向的 ...

能否说具体一些？原点的位置是在哪里？需要怎么设置呢？

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