计算化学公社

标题: 如何统计gromacs计算中原子或分子之间的碰撞次数？ [打印本页]

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-12-17 16:22
标题: 如何统计gromacs计算中原子或分子之间的碰撞次数？
最近听一个报告，提到了可以采用gromacs统计计算过程中发生的分子碰撞次数，但是我没找到类似的语句，想问一下老师们是如何统计分子碰撞次数的，另外发生碰撞的角度是否也可以统计呢

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-18 06:47
据我所知GROMACS没有直接统计这个的功能（或者作者是从gmx算的其它量上面推测出来的）。自己写VMD tcl脚本分析轨迹来统计这个并不困难

作者
Author: sungl123456 时间: 2020-12-19 09:00

sobereva 发表于 2020-12-18 06:47
据我所知GROMACS没有直接统计这个的功能（或者作者是从gmx算的其它量上面推测出来的）。自己写VMD tcl脚本 ...

好的，感谢社长回复

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