计算化学公社

标题: 利用MS研究分子在不同氢浓度下的稳定性的问题 [打印本页]

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西村W    时间: 2020-12-21 12:12
标题: 利用MS研究分子在不同氢浓度下的稳定性的问题
各位老师好,想请问一下MS软件是否可以研究分子的热稳定性。我想研究的内容是在不同氢气浓度下,不同的分子的热稳定性。我之前利用Forcite 模块做了初步探索,但是结果不好。目前的想法是:建立100个氢气分子和待研究分子的晶胞,利用NPT系综跑分子动力学。
有以下几个问题:
1.想要通过P和T条件达到控制氢气浓度的目的,但我不知道这样做是否可行?
2.晶胞的密度如何设置,模拟之后结果只能从能量角度分析稳定性吗?

3.动力学模拟之后的结果能否输出分子的键能?
希望有做过这方面研究的老师能指点一二,不胜感激!

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sobereva    时间: 2020-12-21 12:47
如果你是从是否容易热分解角度考察热稳定性,显然不行。Forcite既不是量化程序,又不支持反应力场,根本都没法描述分解反应,更别提讨论热分解稳定性了

键能根本就不是通过动力学方式来算的。公社论坛首页google框搜 键能,了解相关的计算常识

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西村W    时间: 2020-12-21 13:38
sobereva 发表于 2020-12-21 12:47
如果你是从是否容易热分解角度考察热稳定性,显然不行。Forcite既不是量化程序,又不支持反应力场,根本都 ...

感谢社长回复。键能的计算方式我已经掌握了,但因为我想算的是在外界条件(氢逸度)影响下的键能,就不知道怎么算了。
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sobereva    时间: 2020-12-21 13:53
西村W 发表于 2020-12-21 13:38
感谢社长回复。键能的计算方式我已经掌握了,但因为我想算的是在外界条件(氢逸度)影响下的键能,就不知 ...

没法这么考察
本来键能就是键的内禀特征,不受外环境影响
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西村W    时间: 2020-12-21 14:44
sobereva 发表于 2020-12-21 13:53
没法这么考察
本来键能就是键的内禀特征,不受外环境影响

感谢社长回复。我在一个盒子里填充不同比例的氢气和待研究分子,NPT模拟之后观察待研究分子的总能量,据此判断待研究分子的稳定性,您觉得这种方法是否靠谱呢?
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sobereva    时间: 2020-12-21 15:28
西村W 发表于 2020-12-21 14:44
感谢社长回复。我在一个盒子里填充不同比例的氢气和待研究分子,NPT模拟之后观察待研究分子的总能量,据 ...

你首先得对稳定性有个确切的定义,本身这个词是极为含糊的,有不同衡量方式
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西村W    时间: 2020-12-21 16:26
sobereva 发表于 2020-12-21 15:28
你首先得对稳定性有个确切的定义,本身这个词是极为含糊的,有不同衡量方式

多谢社长回复。主要还是想看热稳定性上的差异,我查到的衡量热稳定性的方式有下面几种(见图片)。我不是纯做化学的,所以想从最简单的方式验证一下,就考虑到直接用分子模拟之后的总能量衡量,但不知道是不是可靠的。
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sobereva    时间: 2020-12-22 02:10
西村W 发表于 2020-12-21 16:26
多谢社长回复。主要还是想看热稳定性上的差异,我查到的衡量热稳定性的方式有下面几种(见图片)。我不是 ...

总能量并不直接说明什么

按照这个逻辑,物质在真空下一定不如溶液下稳定,因为溶液下分子与环境分子相互作用会造成能量降低。然而显然这个结论是错误的
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西村W    时间: 2020-12-22 10:39
sobereva 发表于 2020-12-22 02:10
总能量并不直接说明什么

按照这个逻辑,物质在真空下一定不如溶液下稳定,因为溶液下分子与环境分子相 ...

嗯嗯,谢谢社长了。我再思考思考。




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