计算化学公社

标题: 请教一下关于双核金属有机络合物计算的泛函选择 [打印本页]

作者
Author: Kikyou 时间: 2020-12-22 18:39
标题: 请教一下关于双核金属有机络合物计算的泛函选择
请教一下各位老师，优化一个双核金属的结构，两个金属之间有明显的相互作用（Rh-Rh）。这种情况下使用什么样的泛函比较合适？单点计算的时候呢？我记得之前好像看到过Sob老师说双核金属不能使用杂化泛函，但是我记不太清了。我找了几篇相关文献，发现有使用M06-L和M11-L的，但是也有使用B3LYP的
(, 下载次数 Times of downloads: 133) (, 下载次数 Times of downloads: 45)

另外，如果两个金属距离较远，没有相互作用的话，能不能使用B3LYP等杂化泛函优化呢？

或者，两个金属间存在桥键的情况呢？

作者
Author: biogon 时间: 2020-12-22 18:59
·计算过渡金属之间的化学键（包括过渡金属团簇体系）：PBE、BP86、TPSS、SCAN
没有金属之间成键的话杂化泛函是可以的

作者
Author: Kikyou 时间: 2020-12-22 19:03

biogon 发表于 2020-12-22 18:59
·计算过渡金属之间的化学键（包括过渡金属团簇体系）：PBE、BP86、TPSS、SCAN
没有金属之间成键的话杂化 ...

谢谢您的回复！我还想问一下，是指优化和单点计算都是这几个推荐泛函嘛

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-12-22 20:24

Kikyou 发表于 2020-12-22 19:03
谢谢您的回复！我还想问一下，是指优化和单点计算都是这几个推荐泛函嘛

SCAN个人不太建议用于结构优化，因为势能面不太平滑，其他应该是都推荐的。
另外PBE0、TPSSh也可以考虑。不是说双核金属一定不能用杂化泛函，我自己遇到过金属-金属键能用BP86比实验偏高30kcal/mol，用B3LYP、PBE0正好的情况

作者
Author: biogon 时间: 2020-12-22 21:51

Kikyou 发表于 2020-12-22 19:03
谢谢您的回复！我还想问一下，是指优化和单点计算都是这几个推荐泛函嘛

SCAN在很多程序应该还没有解析梯度，优化就算了

作者
Author: Kikyou 时间: 2020-12-22 21:53

biogon 发表于 2020-12-22 21:51
SCAN在很多程序应该还没有解析梯度，优化就算了

了解了，谢谢！

作者
Author: Kikyou 时间: 2020-12-22 21:53

wzkchem5 发表于 2020-12-22 20:24
SCAN个人不太建议用于结构优化，因为势能面不太平滑，其他应该是都推荐的。
另外PBE0、TPSSh也可以考虑 ...

嗯嗯，我用纯泛函跟B3LYP的结果对比下，谢谢！

作者
Author: biogon 时间: 2020-12-22 21:55

wzkchem5 发表于 2020-12-22 20:24
SCAN个人不太建议用于结构优化，因为势能面不太平滑，其他应该是都推荐的。
另外PBE0、TPSSh也可以考虑 ...

泛函的双核金属键能和NEVPT2 CASPT2的能差多少

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-23 07:59
杂化泛函算过渡金属之间成键在不少文章里体现出很不适合，比如J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 908、J. Chem. Theory Comput. 2015, 11, 4093。建议先尝试能考虑的各种可能靠谱的纯泛函，前面没提到的M15L也可以考虑（M11系列都不要用，非常垃圾）。实在没选择的话再考虑杂化，如果特别想用杂化的话，建议先考虑HF成分较低的而且也经常被拿来算过渡金属的TPSSh-D3(BJ)。强烈不建议用B3LYP算当前问题，被怼的理由太多了。

作者
Author: Kikyou 时间: 2020-12-23 08:51

sobereva 发表于 2020-12-23 07:59
杂化泛函算过渡金属之间成键在不少文章里体现出很不适合，比如J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 908、J. C ...

嗯嗯，了解了，谢谢Sob老师！我现在在用PBE-D3优化结合M06L单点看一下结果~

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-12-23 08:58

wzkchem5 发表于 2020-12-22 20:24
SCAN个人不太建议用于结构优化，因为势能面不太平滑，其他应该是都推荐的。
另外PBE0、TPSSh也可以考虑 ...

PBE0确实，虽说HF成分有25%，但是在优化Fe，Mn，Ru的几个多核配合物的时候金属键长和晶体里面符合的还是比较不错的。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-12-23 17:24

喵星大佬发表于 2020-12-23 08:58
PBE0确实，虽说HF成分有25%，但是在优化Fe，Mn，Ru的几个多核配合物的时候金属键长和晶体里面符合的还是 ...

分子结构方面，HF成分的影响其实不大，主要还是影响键能。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-24 12:25

喵星大佬发表于 2020-12-23 08:58
PBE0确实，虽说HF成分有25%，但是在优化Fe，Mn，Ru的几个多核配合物的时候金属键长和晶体里面符合的还是 ...

具体来说这个和算什么过渡金属有关。对于优化来说
3d系列适合纯泛函或者TPSSh这样HF成份很低的泛函
4d、5d适合PBE0这样HF成份适中的
Buhl等人07年左右发了三篇JCTC，分别对这三类金属做了测试
如果不作任何区分的话，TPSSh属于比较折中的选择。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)