计算化学公社

标题: 18碳环在气相的稳定性如何研究 [打印本页]

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archer    时间: 2020-12-27 15:19
标题: 18碳环在气相的稳定性如何研究
本帖最后由 archer 于 2020-12-27 15:22 编辑

初始O2吸附在C18的环中心,温度调高到1000K进行AIMD模拟,模拟时长2000fs, 观察到O2脱附和C18变形,没有观察到化学反应的发生。文献报道C18在气相中不能稳定存在,通过AIMD如何模拟研究C18在空气中的变化?


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喵星大佬    时间: 2020-12-27 15:56
我怀疑你把氧气当成闭壳层了
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granvia    时间: 2020-12-27 16:21
1个trajectory可能不能说明问题。改变初始坐标和原子速度,算多个trajectory
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wzkchem5    时间: 2020-12-27 16:33
加了周期性边界条件或者限制势了吗
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archer    时间: 2020-12-27 17:43
喵星大佬 发表于 2020-12-27 15:56
我怀疑你把氧气当成闭壳层了

系统的自旋多重度设置的是3
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archer    时间: 2020-12-27 17:44
wzkchem5 发表于 2020-12-27 16:33
加了周期性边界条件或者限制势了吗

这个没有加
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archer    时间: 2020-12-27 17:44
granvia 发表于 2020-12-27 16:21
1个trajectory可能不能说明问题。改变初始坐标和原子速度,算多个trajectory

用O2直接去碰撞或许能反应
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granvia    时间: 2020-12-27 17:58
archer 发表于 2020-12-27 17:43
系统的自旋多重度设置的是3

这个显然有问题。反应后基态很可能不再是三重态
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liyuanhe211    时间: 2020-12-27 19:34
1000 K, 2000 fs 能反应对应的势垒才 5 kcal/mol。
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sobereva    时间: 2020-12-27 20:52
研究这种问题是很讲究的。不同相对朝向和位置、不同速度打来,结果截然不同。绝对不是简单摆在一起跑个特定温度的动力学就能说明问题的。

最近有一篇H、H2打到C18分别形成C18H、C18H2的文章,有的思想可以参考。但这篇文章用的DFTB算的,并不靠谱。DFTB,以及GFN-xTB,都没法定性正确描述18碳环的几何和电子结构。
https://doi.org/10.1016/j.radphyschem.2020.109166
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archer    时间: 2020-12-27 22:00
sobereva 发表于 2020-12-27 20:52
研究这种问题是很讲究的。不同相对朝向和位置、不同速度打来,结果截然不同。绝对不是简单摆在一起跑个特定 ...

谢谢sob老师,我看了您的文章,PM7能够重复C18的结构,似乎可以用半经验方法的研究。
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sobereva    时间: 2020-12-28 06:55
archer 发表于 2020-12-27 22:00
谢谢sob老师,我看了您的文章,PM7能够重复C18的结构,似乎可以用半经验方法的研究。

能定性描述对极小点结构也不能全部说明问题,因为可能对势能面形状描述很差,尤其是涉及到化学反应、偏离平衡结构很大的区域,半经验的可靠性就更难说了。你可以算着玩玩,但如果发文章的话,需要做好面对审稿人质疑的准备。
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wzkchem5    时间: 2020-12-28 08:58
archer 发表于 2020-12-27 17:44
这个没有加

那只要这个反应在单次碰撞下发生的几率比较低,氧气分子就会在还没发生反应之前离开18碳环
所以要么增加分子的初速度,使得一两次碰撞就能反应,要么把分子限制在一个有限空间里,或者加周期性边界条件,使得两个分子彼此之间可以多次碰撞
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阿瞳    时间: 2022-4-20 16:19
可以看看这篇说C18在气相中不能稳定存在的文献吗
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archer    时间: 2022-4-21 11:28
阿瞳 发表于 2022-4-20 16:19
可以看看这篇说C18在气相中不能稳定存在的文献吗

Science 2019合成出C18的文献




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