计算化学公社

标题: 求助加固定方向电场下对分子进行势能面柔性扫描 [打印本页]

作者
Author: shuyaozhou 时间: 2020-12-29 13:49
标题: 求助加固定方向电场下对分子进行势能面柔性扫描
我想在1号和2号原子连线方向施加电场实现1个二面角的势能面扫描。现在1号和2号原子连线是指定的电场方向(z方向)，想对1个二面角进行柔性扫描，请教一下该怎样写文本可以实现扫描过程中指定电场方向的2个原子保持在z轴上（即2个原子连线一直是电场方向）？现在输出文本表明这2个原子的连线方向也在变动。谢谢！ (, 下载次数 Times of downloads: 15)

作者
Author: doublezhang 时间: 2020-12-29 15:43
我抛砖引玉噢
1. 先不管坐标，生成一大堆不同二面角的分子结构可能这篇对你有用？http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
2. http://sobereva.com/177 用这篇文章的方法把你想要的键对住z轴
3. http://sobereva.com/404 用这篇文章的方法把输入文件里的这两个原子固定住，记得加上nosymm
4. 把这些输入文件投上去算
5. 打开手机，开始一把紧张刺激的王者荣耀排位赛

作者
Author: shuyaozhou 时间: 2020-12-29 18:05
谢谢！请问有办法在加电场扫势能面时就保证这2个原子保持在z轴上吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-30 08:45

shuyaozhou 发表于 2020-12-29 18:05
谢谢！请问有办法在加电场扫势能面时就保证这2个原子保持在z轴上吗？

2L第三条都已经明确说了

作者
Author: shuyaozhou 时间: 2020-12-30 10:40
谢谢社长！请问能不固定住这两个原子吗？我只想限制住这2个原子连线的方向，请问有办法吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-2 20:06

shuyaozhou 发表于 2020-12-30 10:40
谢谢社长！请问能不固定住这两个原子吗？我只想限制住这2个原子连线的方向，请问有办法吗？

用GIC实现限制性优化，让这两个原子的X、Y坐标都为0，Z坐标可变
在Gaussian中做限制性优化的方法
http://sobereva.com/404（http://bbs.keinsci.com/thread-9022-1-1.html）

作者
Author: shuyaozhou 时间: 2021-1-23 03:04

sobereva 发表于 2021-1-2 20:06
用GIC实现限制性优化，让这两个原子的X、Y坐标都为0，Z坐标可变
在Gaussian中做限制性优化的方法
http: ...

谢谢社长！

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