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标题: 求助：研究蛋白与二糖互作，应该选择哪个力场 [打印本页]

作者
Author: rookie 时间: 2020-12-29 20:41
标题: 求助：研究蛋白与二糖互作，应该选择哪个力场
各位老师好，我想研究下蛋白与二糖的互作，想跑md，请问下现在最适合这个体系的力场是什么,在哪里可以下载到相关的力场包，对于二糖应该进行什么处理。

谢谢各位老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-30 08:47
诸如CHARMM就同时支持蛋白和糖
兼容GROMOS的有56A_CARBO、56ACARBO_R可以描述糖

作者
Author: gongrehk 时间: 2022-6-20 16:34
老师请问可以分享一个mdp文件吗？准备用Gromacs模拟一下蛋白和二糖，准备同时选择CHARMM力场。不过不知道mdp文件怎么改，之前只模拟过蛋白质水溶液，那个比较简单。谢谢！

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