计算化学公社

标题: 在Multiwfn使用AdNDP方法分析体系作用 [打印本页]

作者
Author:
wang1345    时间: 2015-11-13 10:16
标题: 在Multiwfn使用AdNDP方法分析体系作用
我想问一下,用AdNDP方法分析体系中作用的时候,如果为弱相互作用,是不是相互作用的原子间不能做出2e-2e轨道?如果为共价作用是不是就能做出2c-2e的轨道?
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文献中的AdNDP轨道是用什么软件做出来的?是Multiwfn软件吗?
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这两个图是我自己做出来的AdNDP轨道,我不知道对不对,第一个图中的复合物我分析的为非共价相互作用,做出的2c-2e轨道是这样的;第二个图中的复合物分析的为共价作用,做出的2c-2e轨道是这样的,并且共价作用的体系中1c-1e中没有出现在形成复合物时提供孤对电子的原子,这是为什么?

作者
Author:
sobereva    时间: 2015-11-13 20:24
只有共价相互作用之间才会有2c-2e
对于非共价相互作用,两个原子之间如果离得近,AdNDP也能找出2c-2e,但这样的肯定占据数很低,你取它没意义。非共价相互作用不适合AdNDP分析。适合的分析方式这里都讨论了
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

AdNDP分析一个是产生AdNDP数据,一个是作图。Multiwfn二者都能干,能得到和文献里的一样的结果,当然作图效果、颜色、材质这些会不同。你把AdNDP轨道数据导出成cube文件,之后能用各种各样的工具作图,这就随意了。VMD也完全可以作出同样效果的图,但文中肯定不是VMD作的。





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