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标题: 高斯可以做固定温度的计算吗? [打印本页]

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小和尚    时间: 2015-11-13 11:29
标题: 高斯可以做固定温度的计算吗?
计算一下我的结构在不同温度的性质,请问高斯软件做吗?

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liyuanhe211    时间: 2015-11-13 17:30
温度是宏观量!没有“一个分子的温度”这一说。温度不影响Opt的结构,Freq里可以设置温度,不过无非是类似于G=H-TS里面改变一下T这样的修正。

不懂分子模拟软件,可能用分子模拟可以做这件事情
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savorw    时间: 2015-11-13 17:48
Gauss做不了这事, Gauss都做的0K下的气态, FREQ也只是算配分函数进行热力学校正,改变不了结构,要做这事,只有做MD
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sobereva    时间: 2015-11-13 18:06
算过渡态、几何结构、IRC这些,根本不是温度的函数,原理上温度根本不会影响这些问题

高斯(以及几乎所有其它量化程序)中考虑温度,只能是做振动分析获得热力学量的时候,以及做从头算动力学的时候。

量化程序算热力学量的时候都是假定体系是理想气体分子。
你可以算不同温度下的比如反应焓、自由能垒、平衡常数等等,但记得程序都是把体系当成理想气体考虑的。也可以用隐式溶剂模型,但此时只不过是把溶剂当成连续介质作为外场来处理。
量化程序计算温度对热力学量的影响时都是按照现成的热力学公式来算的,这里写得很清楚:http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=123。真正明确地考虑温度只有做分子动力学、蒙特卡罗模拟的时候。


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小和尚    时间: 2015-11-13 21:52
sobereva 发表于 2015-11-13 18:06
算过渡态、几何结构、IRC这些,根本不是温度的函数,原理上温度根本不会影响这些问题

高斯(以及几乎所 ...

好的,非常感谢啊!我之前想计算的是离子间的相互作用随温度的变化。
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stecue    时间: 2015-11-13 22:41
小和尚 发表于 2015-11-13 21:52
好的,非常感谢啊!我之前想计算的是离子间的相互作用随温度的变化。

溶液中?Electronic coupling和库仑力之类的相互作用本身是不随温度变化的,但是温度可以改变分子的构象从而间接改变electronic coupling。
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sobereva    时间: 2015-11-14 00:32
小和尚 发表于 2015-11-13 21:52
好的,非常感谢啊!我之前想计算的是离子间的相互作用随温度的变化。

量化角度没法讨论这个。
你得做动力学模拟,可以观察到不同温度下离子间rdf曲线、平均作用距离之类会发生变化,另外可以通过aRDG方法考察相互作用,见
使用Multiwfn研究分子动力学中的弱相互作用
http://sobereva.com/186
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小和尚    时间: 2015-11-14 17:08
liyuanhe211 发表于 2015-11-13 17:30
温度是宏观量!没有“一个分子的温度”这一说。温度不影响Opt的结构,Freq里可以设置温度,不过无非是类似 ...

谢谢啊!
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小和尚    时间: 2015-11-14 17:08
savorw 发表于 2015-11-13 17:48
Gauss做不了这事, Gauss都做的0K下的气态, FREQ也只是算配分函数进行热力学校正,改变不了结构,要做这事, ...

谢谢啊




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