计算化学公社

标题: 论坛里面,有木有人使用dalton程序? [打印本页]

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迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-7 11:53
标题: 论坛里面,有木有人使用dalton程序?
论坛里面,有木有人使用dalton程序?希望可以相互学习和讨论。
一直在用dalton计算金属配合物的SOC常数、磷光速率和ZFS,但有的关键词还不是很确定,模拟出来的数据偏差和别人模拟的相差两个数量级(同分子同程序):'(。有问过对方课题组相关的计算的信息,对方说文件输入没什么问题,可是就是做的不对。
相关的输入命令已上传,求同行指导!



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pwang123    时间: 2014-11-8 12:43
我用DALTON算core level ionization energy,做的跟LZ的不一样哎,,,
作者
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小范范1989    时间: 2014-11-10 08:02
我想问一下,我也用dalton,能不能计算旋轨耦合常数??
作者
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迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-10 16:46
小范范1989 发表于 2014-11-10 08:02
我想问一下,我也用dalton,能不能计算旋轨耦合常数??

可以的  用AMFI
作者
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迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-10 16:47
本帖最后由 迷茫的小飞侠 于 2014-11-10 16:50 编辑
pwang123 发表于 2014-11-8 12:43
我用DALTON算core level ionization energy,做的跟LZ的不一样哎,,,

没事,你计算的物质有金属吗?我现在特别困惑的是对赝势基组的定义,因为手册里面提到Ir和Pt的有效核电势与我们之前说的77,78不一样。
作者
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小范范1989    时间: 2014-11-10 17:33
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-10 16:46
可以的  用AMFI

AMFI是什么?我在2013手册中看了看。说来计算自旋轨道耦合的,但是,我在看你的.dal文件中,没有看到这个关键词啊?

**DALTON INPUT
.DIRECT
.RUN RESPONS
**INTEGRALS
.SPIN-ORBIT
**WAVE FUNCTIONS
.DFT
B3LYP
**RESPONS
*QUADRATIC
.SINGLE RESIDUE
.PHOSPHORSCENCE
.ROOTS
3
**END OF DALTON INPUT
请问一下,你这个是计算旋轨耦合吗?还是计算磷光?2013手册中,我没有查到磷光啊?
要是能计算磷光,是不是就能计算荧光?通过这个.dal文件,计算出来的磷光,有哪些信息?
谢谢你。
我刚刚开始接触dalton计算旋轨耦合还有荧光计算,之前,我都是计算的光吸收的东西。
谢谢你
作者
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迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-10 18:16
小范范1989 发表于 2014-11-10 17:33
AMFI是什么?我在2013手册中看了看。说来计算自旋轨道耦合的,但是,我在看你的.dal文件中,没有看到这个 ...

不是 这个是算磷光寿命和速率常数的,算SOC是另外的关键词 因为我也在测试 只有部分是算对了的
你试一下下面的这个

**DALTON INPUT
.DIRECT
.RUN RESPONS
**INTEGRALS
.MNF-SO
.PRINT
6
**WAVE FUNCTIONS
.DFT
PBE0
*OPTIMIZATION
.DETERMINANTS
**RESPONSE
.TRPFLG
*LINEAR
.SINGLE RESIDUE
.PROPRT
Z1MNF-SO   
.ROOTS
1
**END OF DALTON INPUT
算出来给我说一些 嘿嘿 我也是个菜鸟  需要讨论啊
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-10 18:16
小范范1989 发表于 2014-11-10 17:33
AMFI是什么?我在2013手册中看了看。说来计算自旋轨道耦合的,但是,我在看你的.dal文件中,没有看到这个 ...

不是 这个是算磷光寿命和速率常数的,算SOC是另外的关键词 因为我也在测试 只有部分是算对了的
你试一下下面的这个

**DALTON INPUT
.DIRECT
.RUN RESPONS
**INTEGRALS
.MNF-SO
.PRINT
6
**WAVE FUNCTIONS
.DFT
PBE0
*OPTIMIZATION
.DETERMINANTS
**RESPONSE
.TRPFLG
*LINEAR
.SINGLE RESIDUE
.PROPRT
Z1MNF-SO   
.ROOTS
1
**END OF DALTON INPUT
作者
Author:
小范范1989    时间: 2014-11-10 21:47
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-10 18:16
不是 这个是算磷光寿命和速率常数的,算SOC是另外的关键词 因为我也在测试 只有部分是算对了的
你试一 ...

偶?也就是说,通过你前一个的.dal文件,能算磷光寿命和速率常数?那要是计算荧光的寿命,还有辐射跃迁速率,隙间跨越速率,反隙间跨越速率,是不是也能通过dalton计算?
再就是,附上,我做旋轨耦合时的错误。

@ MPI MASTER, node no.:     0
@ Reason: Response vector not found on file RSPVEC
作者
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小范范1989    时间: 2014-11-10 21:55
本帖最后由 小范范1989 于 2014-11-11 14:47 编辑
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-10 18:16
不是 这个是算磷光寿命和速率常数的,算SOC是另外的关键词 因为我也在测试 只有部分是算对了的
你试一 ...


麻烦帮看一下错误。谢谢
再就是,你说的这个AMFI,怎么在.dal中体现?谢谢
作者
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小范范1989    时间: 2014-11-11 14:55
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-10 18:16
不是 这个是算磷光寿命和速率常数的,算SOC是另外的关键词 因为我也在测试 只有部分是算对了的
你试一 ...

你好,按照你给的这个.dal文件,我计算出来了,好像是旋轨耦合常数。是不是输出文件的最后?
**************************************************************************************
*** @ Excit. operator sym 1 & ref. state sym 1 => excited state symmetry 1  ( A  ) ***
**************************************************************************************



@ Excited state no:    1 in symmetry 1  ( A  )
----------------------------------------------

@ Excitation energy :  3.35617265E-02 au
@                     0.91326103     eV;   7365.9475     cm-1;   88.116299     kJ / mol

@ Total energy :      -2123.7690     au

@ Operator type:    Z1MNF-SO
@ Spin-orbit coupling constant (Z1MNF-SO) : -6.81383248E-03 cm-1
                                           -3.10461054E-08 au
这个???
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-12 14:36
小范范1989 发表于 2014-11-11 14:55
你好,按照你给的这个.dal文件,我计算出来了,好像是旋轨耦合常数。是不是输出文件的最后?
********* ...

这个我还在学习 也不是很清楚这样算究竟对不对:'(
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-12 14:37
小范范1989 发表于 2014-11-10 21:55
麻烦帮看一下错误。谢谢
再就是,你说的这个AMFI,怎么在.dal中体现?谢谢

手册里面和dalton程序自带的例子里面有详细的输入说明,我是模仿那个计算来着呢,具体的我就说不上来了,看手册哦
作者
Author:
小范范1989    时间: 2014-11-12 14:55
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-12 14:36
这个我还在学习 也不是很清楚这样算究竟对不对

偶,谢谢你,有没有一个分子,已经知道他的旋轨耦合系数,通过我们的计算,来对比一下,看看您给的这个.dal计算你对不对?我找了找,没找到这样的。是不是实验上多?
作者
Author:
pwang123    时间: 2014-11-12 23:27
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-10 16:47
没事,你计算的物质有金属吗?我现在特别困惑的是对赝势基组的定义,因为手册里面提到Ir和Pt的有效核电势 ...

我算的是C,H and O atom,用的是cc-pv5z基组,没有yanshi
sorry
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-13 21:47
小范范1989 发表于 2014-11-12 14:55
偶,谢谢你,有没有一个分子,已经知道他的旋轨耦合系数,通过我们的计算,来对比一下,看看您给的这个.d ...

你试一下07年Hans Agren课题组的一篇文章有做,具体的我没有比较 我现在的计算属于测试阶段:'(:'(,有太多不稳定的因素了
作者
Author:
小范范1989    时间: 2014-11-13 22:16
好的,谢谢你。我仔细找找看看
作者
Author:
小范范1989    时间: 2014-11-14 09:35
迷茫的小飞侠 发表于 2014-11-13 21:47
你试一下07年Hans Agren课题组的一篇文章有做,具体的我没有比较 我现在的计算属于测试阶段,有太 ...

能否把那个文章发上来看看?我搜了搜,没找到。谢谢啊
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2014-11-14 18:04
pwang123 发表于 2014-11-12 23:27
我算的是C,H and O atom,用的是cc-pv5z基组,没有yanshi
sorry

在使用dalton的时候,是不是都需要定义SCF input这部分呢?困惑ing:(
作者
Author:
blueyangliu    时间: 2015-4-3 10:36
我也在学习dalton,有没有关于这个软件的qq群?我建不了
作者
Author:
小范范1989    时间: 2015-4-3 15:14
blueyangliu 发表于 2015-4-3 10:36
我也在学习dalton,有没有关于这个软件的qq群?我建不了

qq群我倒是没有,感觉用dalton的人比较少,除了问题什么的解决办法没有高斯多
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2015-4-16 17:34
blueyangliu 发表于 2015-4-3 10:36
我也在学习dalton,有没有关于这个软件的qq群?我建不了

我可以建  但是我最这个程序只会皮毛中的皮毛 不知道好不好
作者
Author:
blueyangliu    时间: 2015-4-17 09:16
都是初学者,这个用的人少,有问题也可以去dalton官方论坛查查
作者
Author:
迷茫的小飞侠    时间: 2015-4-20 11:57
blueyangliu 发表于 2015-4-17 09:16
都是初学者,这个用的人少,有问题也可以去dalton官方论坛查查

是呢,基本的好学,主要是遇到有的问题或报错,我们不知道该怎么去解决
作者
Author:
小范范1989    时间: 2015-11-10 20:48
飞侠,再来咨询你一下,
你现在会计算旋轨耦合吗?
比如说s1-t1和t1-s0的,怎么计算?
作者
Author:
beefly    时间: 2015-11-12 09:18
本帖最后由 beefly 于 2016-12-5 00:20 编辑

dalton不支持用ecp计算旋轨耦合。在这个计算中,把Ir当作轻元素处理了
最新版本可以了,用.ECPHOS。但是必须对ECP的SOC做了参数化,否则结果是错的。源代码中的SOC参数依赖于原子类型和芯电子个数,大部分重元素都不支持

作者
Author:
blueyangliu    时间: 2016-12-5 00:10
beefly 发表于 2015-11-12 09:18
dalton不支持用ecp计算旋轨耦合。在这个计算中,把Ir当作轻元素处理了

那重金属原子怎么计算呢
作者
Author:
beefly    时间: 2016-12-5 00:21
blueyangliu 发表于 2016-12-5 00:10
那重金属原子怎么计算呢

现在原则上可以了,但程序未必对SOC参数做了优化。见上




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