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标题: 在VMware虚拟机上安装gaussian测试计算时一直出现ntrex1错误，该如何处理呢 [打印本页]

作者
Author: zx4562430 时间: 2020-12-31 17:24
标题: 在VMware虚拟机上安装gaussian测试计算时一直出现ntrex1错误，该如何处理呢
本帖最后由 zx4562430 于 2020-12-31 17:29 编辑

各位大佬，求帮忙提提意见，谢谢各位老师VMware版本装的是16版本，gaussian是gaussian 09 D01,VMware虚拟机安装时设置的内存2G，硬盘设置的是100G（一块固态硬盘上），处理器数1，内核数20（买的是双路服务器2个cpu，共20核），先装了CentOS 7 64位系统，用root用户在/opt/software/目录下安装gaussian，新建了个/opt/software/scratch文件夹，设置环境变量为：

export g09root=/opt/software/g09d01
export GAUSS_SCRDIR=/opt/software/scratch
source /opt/software/g09d01/g09/bsd/g09.profile

通过共享文件夹（在另一块机械硬盘上），测试这个文件夹内一个gaussian任务计算，任务如下（附件是详细文件）：
%mem=64GB
%nprocs=20
%chk=c3n4.chk
%rwf=94.rwf,50GB,95.rwf,50GB,96.rwf,50GB,97.rwf,50GB
#p opt freq B3LYP/6-31+g(d)

...;
计算总是出现如下ntrex1是为啥呢？（怕其他用户权限没弄好，特意在root用户下进行测试）
[root@node01 ~]# cd /mnt/hgfs/gaussian
[root@node01 gaussian]# g09 c3n4.gjf&
[1] 103136
[root@node01 gaussian]# ntrex1: Input/output error
Error: segmentation violation
rax 0000000000000000, rbx 0000000000000001, rcx ffffffffffffffff
rdx 00000000000192e7, rsp 00007fffdc7ac0d8, rbp 00007fffdc7ac1d0
rsi 000000000000000b, rdi 00000000000192e7, r8  00002b916ab622c0
r9  0000000000000000, r10 00007fffdc7ab520, r11 0000000000000206
r12 0000000000000004, r13 0000000000747c10, r14 0000000000000001
r15 0000000000010000
  --- traceback not available

[1]+  Exit 1                g09 c3n4.gjf

log文件最后如下：
******************************************
%mem=64GB
%nprocs=20
Will use up to 20 processors via shared memory.
%chk=c3n4.chk
%rwf=94.rwf,50GB,95.rwf,50GB,96.rwf,50GB,97.rwf,50GB
ntrex1

这个到底是因为什么呢？ (, 下载次数 Times of downloads: 5)

(, 下载次数 Times of downloads: 11)

作者
Author: sobereva 时间: 2020-12-31 17:41
虚拟机才给了2GB内存，怎么可能用%mem=64GB。
另外，%rwf写一大串根本没意义，你又不是让rwf分开在不同目录下写，何故写那些

作者
Author: zx4562430 时间: 2020-12-31 18:16

sobereva 发表于 2020-12-31 17:41
虚拟机才给了2GB内存，怎么可能用%mem=64GB。
另外，%rwf写一大串根本没意义，你又不是让rwf分开在不同目 ...

卢老师，我把虚拟机内存设置为128G，rwf也删了，还是同样的错误。这个ntrex1到底是因为啥呢？

作者
Author: wxhwbh 时间: 2021-1-1 12:02

zx4562430 发表于 2020-12-31 18:16
卢老师，我把虚拟机内存设置为128G，rwf也删了，还是同样的错误。这个ntrex1到底是因为啥呢？

你确定你物理机有128G内存吗？
一般来说高斯没必要设那么大内存，除非你体系特别大或任务特别吃内存

作者
Author: thanhtam 时间: 2021-1-1 12:44
20核128G内存的配置还是直接装linux吧，虚拟机有点性能浪费

作者
Author: Yuyong 时间: 2021-1-1 13:31
虚拟机的内存还没你输入文件写的内存大，出问题不很正常么

作者
Author: zx4562430 时间: 2021-1-1 14:47

wxhwbh 发表于 2021-1-1 12:02
你确定你物理机有128G内存吗？
一般来说高斯没必要设那么大内存，除非你体系特别大或任务特别吃内存

有，我让别人特意加的内存

作者
Author: zx4562430 时间: 2021-1-1 14:48

Yuyong 发表于 2021-1-1 13:31
虚拟机的内存还没你输入文件写的内存大，出问题不很正常么

后面把内存改了还是出问题很奇怪

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-2 00:03

zx4562430 发表于 2020-12-31 18:16
卢老师，我把虚拟机内存设置为128G，rwf也删了，还是同样的错误。这个ntrex1到底是因为啥呢？

大概率是临时文件目录下没法创建临时文件，检查读写权限

作者
Author: emfance 时间: 2022-9-20 20:21
%chk 有问题把C:\去掉试试

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