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标题: 添加离子时出现“Invalid order for directive atomtypes”的问题时怎么解决？ [打印本页]

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Author: 黑择明 时间: 2021-1-3 19:26
标题: 添加离子时出现“Invalid order for directive atomtypes”的问题时怎么解决？
我在运行命令：gmx grompp -f ions.mdp -c shierwanji_solv.gro -p shierwanji_solv.top -o ions.tpr 时，出现了Invalid order for directive atomtypes的错误，求大神指教！

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Author: sobereva 时间: 2021-1-3 20:01
老生常谈的问题，论坛首页搜索框搜索Invalid order立马找到答案

作者
Author: 黑择明 时间: 2021-1-4 10:38

sobereva 发表于 2021-1-3 20:01
老生常谈的问题，论坛首页搜索框搜索Invalid order立马找到答案

老师，我搜索了相关问题，更正了我的itp文件，但是不知道为什么还是会有这个错误。itp和top文件是在Ligpargen网站上生成的，附上我的itp文件和top文件给您再看一下。刚接触gromacs，比较傻瓜的问题请老师见谅，期待您的回复。

作者
Author: 黑择明 时间: 2021-1-4 13:39

sobereva 发表于 2021-1-3 20:01
老生常谈的问题，论坛首页搜索框搜索Invalid order立马找到答案

不好意思老师，耽误您时间啦，问题已经解决，十分荣幸得到您的答复，祝您生活愉快。

作者
Author: 周子曦 时间: 2021-3-18 14:50

黑择明发表于 2021-1-4 10:38
老师，我搜索了相关问题，更正了我的itp文件，但是不知道为什么还是会有这个错误。itp和top文件是在Ligpa ...

你好，请问您这个问题最后怎么解决的，我也根据论坛里的将itp文件中的[atomtypes]都剪切至top文件里了，但是还是出现相同报错

作者
Author: Lacrimosa 时间: 2021-3-18 18:40

周子曦发表于 2021-3-18 14:50
你好，请问您这个问题最后怎么解决的，我也根据论坛里的将itp文件中的[atomtypes]都剪切至top文件里了， ...

直接把[atomtypes]全部剪切到力场文件/ffnonbonded.itp 中的相应位置

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