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标题: 用什么方法可以算对称性的分子 [打印本页]

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-14 01:09
标题: 用什么方法可以算对称性的分子
如题，想问下有什么方法可以算对称性的分子？我试过MP2，CCSD，DFT-D3，所有这些分子算出来没有虚频的都是C1对称性的。如果我把分子设成Cs对称性的，每种方法算出来都有虚频。那个虚频是甲基的转动和另一个甲基的wagging振动模式。希望有大牛指导，十分感谢！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-11-14 01:20
这样难道不说明这个分子本来就不应该是对称的嘛~~
宏观上对称和分子最低能态对称是两码事，按计算来说过氧化氢还应该能拆分呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-14 06:00
什么方法都能算有对称性的分子。根本不是理论方法的问题。

诸如双氧水，本身极小点结构就不是平面的，你非要用平面的构型来算，用什么方法算出来都是有虚频的。虚频代表当前所用的结构不是当前方法下的极小点结构。

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-14 08:03

liyuanhe211 发表于 2015-11-14 01:20
这样难道不说明这个分子本来就不应该是对称的嘛~~
宏观上对称和分子最低能态对称是两码事，按计算来说过氧 ...

因为我的实验证明我的这个分子体系必须是对称的

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-14 08:11

liyuanhe211 发表于 2015-11-14 01:20
这样难道不说明这个分子本来就不应该是对称的嘛~~
宏观上对称和分子最低能态对称是两码事，按计算来说过氧 ...

这个有什么参考文献吗？我也看到一些文献尽管算出来是对称的，有虚频，在文章中只提了提，还是继续用的对称的结构。我不知道怎么处理，很纠结。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-11-14 11:04
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-14 11:05 编辑

flybird52888 发表于 2015-11-14 08:03
因为我的实验证明我的这个分子体系必须是对称的

实验也证明过氧化氢不能拆分，所以它应该是平面的？我认为这是常识，你可以尝试用两个极小点之间的快速转换来解释。

作者
Author: beefly 时间: 2015-11-14 11:14

flybird52888 发表于 2015-11-14 08:03
因为我的实验证明我的这个分子体系必须是对称的

有很多可能性：
1，实验是溶剂环境或凝聚态，计算是真空环境，没有可比性
2，实验精度不够
3，理论模型不适用

作者
Author: 虎王 时间: 2015-11-14 21:39

flybird52888 发表于 2015-11-14 08:03
因为我的实验证明我的这个分子体系必须是对称的

什么实验？

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-15 03:38
微波光谱
我们做的是气相的
实验精确性应该没有什么怀疑的

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-15 03:41

beefly 发表于 2015-11-14 11:14
有很多可能性：
1，实验是溶剂环境或凝聚态，计算是真空环境，没有可比性
2，实验精度不够

我觉得理论模型可能不适合，但是我也不知道用什么理论模型比较好，老板建议用CCSD(t), 但是我嫌CCSD(t)不能优化，不能说明问题，不知道你们有什么好的建议吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-11-15 06:07

flybird52888 发表于 2015-11-15 03:41
我觉得理论模型可能不适合，但是我也不知道用什么理论模型比较好，老板建议用CCSD(t), 但是我嫌CCSD(t)不 ...

什么合适看你算的什么体系。
CCSD优化+频率计算有虚频的体系，在CCSD(T)下优化+频率计算也几乎一定有虚频。
CCSD(T)不是不能优化，而是绝大多数程序里没有解析梯度，用数值梯度速度极慢。

PS：别一句话回复一次，已经把你三次零散的回复合并了。

作者
Author: flybird52888 时间: 2015-11-16 10:01
恩，是啊！因为我的体系里面有稀有气体原子，它和普通的分子作用很弱，我之前一直用mp2算的

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