计算化学公社

标题: 求助,vmd中用POV-ray导出的图片中原子的颜色改变 [打印本页]

作者
Author:
libo371324    时间: 2021-1-11 15:44
标题: 求助,vmd中用POV-ray导出的图片中原子的颜色改变
转换的pdb文件有些元素在转换过程中不能识别,比如氮元素和钠元素,然后用vmd自带的功能来实现原子颜色设置问题,散落的是钠原子,我把它设置成棕色,但是用插件导出后钠原子又变成了蓝色。







作者
Author:
liuyuje714    时间: 2021-1-11 16:35
本帖最后由 liuyuje714 于 2021-1-11 16:46 编辑

上次帖子就让你把元素补全然后直接通过元素调色你怎么不做,并非难事。然后渲染出的正常。

作者
Author:
snljty    时间: 2021-1-11 17:12
因为你另一个显示方式没关掉这个原子,所以有两个显示方式。现在显示的是下面那个在表面,但是渲染时候可能会变。上一个显示选not resname xxx即可。但是如果有共价键的情况,这样显示的键又会不对。另一种解决方式是把你下面的显示方式,原子半径比例加大一点,比如到1.05。楼上的也是好办法。
作者
Author:
libo371324    时间: 2021-1-12 09:05
snljty 发表于 2021-1-11 17:12
因为你另一个显示方式没关掉这个原子,所以有两个显示方式。现在显示的是下面那个在表面,但是渲染时候可能 ...

ok,已解决。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3