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标题: 求助:gromacs是使用平底势能时效率问题 [打印本页]

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1900    时间: 2021-1-13 10:13
标题: 求助:gromacs是使用平底势能时效率问题
本帖最后由 1900 于 2021-1-13 10:17 编辑

我使用平底势能后,并行使用40个核也非常的慢。平时用40个核一天能跑30多ns,现在基本上处于跑不动的状态,跟用一个核差不多。请问这是什么情况啊?多谢多谢
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jimulation    时间: 2021-1-13 11:00
问题可能出在SIMD那行?可以试试编译时加上-DGMX_SIMD=AVX2_256试试
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1900    时间: 2021-1-13 11:12
jimulation 发表于 2021-1-13 11:00
问题可能出在SIMD那行?可以试试编译时加上-DGMX_SIMD=AVX2_256试试

好的,我试试看,多谢多谢
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sobereva    时间: 2021-1-15 06:12
碰到问题首先想到先用最新版本再试
5.1.5已经很老了




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