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标题: 求助:如何计算多环芳烃各个环的NICS? [打印本页]

作者
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邱美佳    时间: 2021-1-13 21:43
标题: 求助:如何计算多环芳烃各个环的NICS?
我只会计算单独一个苯环的NICS,但是像萘或菲这种多元芳烃的如何计算单独每一个环的NICS呢?

作者
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Jing求索    时间: 2021-1-13 22:02
本帖最后由 Jing求索 于 2021-1-17 17:13 编辑

:) :) :)
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1366731169    时间: 2021-1-13 22:11
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wzkchem5    时间: 2021-1-13 22:12
算单个苯环不是取碳原子的中心嘛
你算多环芳烃的单个环,就取组成那个环的原子的中心就行了
作者
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邱美佳    时间: 2021-1-14 10:01
Jing求索 发表于 2021-1-13 22:02
邱美佳,
我是菜鸟,能添加我成为朋友吗?
我想向你提出问题,我挺着急的...

添加第一个五元环的时候先限制点群为D5h,然后用ctrl+shift+v重叠复制一个茂环,再用alt+中建把他拉出来。然后用alt+ctrl进行旋转,然后将点群限制为D5d。添加铁原子的话就选中所有原子,然后点击builder里面的place fragment at centroid那一项就可以。要检查每次添加点群是不是添加成功。可以用同样的方法在两个五元环的中心添加随便什么原子,然后调节中心的原子与铁原子的距离就可以。
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邱美佳    时间: 2021-1-14 10:03
wzkchem5 发表于 2021-1-13 22:12
算单个苯环不是取碳原子的中心嘛
你算多环芳烃的单个环,就取组成那个环的原子的中心就行了

是不是在各个环中心都添加虚原子,就可以同时算各个环的NICS呀?
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wzkchem5    时间: 2021-1-14 10:31
邱美佳 发表于 2021-1-14 10:03
是不是在各个环中心都添加虚原子,就可以同时算各个环的NICS呀?

可以
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sobereva    时间: 2021-1-15 05:53
Jing求索 发表于 2021-1-13 22:02
邱美佳,
我是菜鸟,能添加我成为朋友吗?
我想向你提出问题,我挺着急的...

别在其它帖子里问和主题无关的问题,属于扰乱论坛秩序的行为,下次直接删帖+扣分处理




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