计算化学公社

标题: tcl脚本求助 [打印本页]

作者
Author: sun666 时间: 2021-1-13 22:35
标题: tcl脚本求助
社长好，最近想对模拟进行分析，在学习tcl，由于没有任何编程基础，所以看的似懂非懂。有些问题想求助,tcl跟vmd的关系搞不懂。
1.例如培训中的例子hb.tcl
% proc hb {fps1 fps2 donor accept} {
set cum 0
for {set i $fps1} {$i<=$fps2} {incr i 1} {
set dd [atomselect top "index $doner" frame $i]
set aa [atomselect top "index $aceept" fram $i]
set temp [measure hbonds 3.5 35 $dd $aa]
if {$temp !="{} {} {}"} {puts $i ; incr cum}
}
puts $cum

中的donor和accept是VMD的选择语句吗比如输入
proc 1 100 resname SOL resanme SOL

2.vmd中的 atomeselect top "name CA"中的top指的是此时VMD中出现的画面的离子吗

作者
Author: sobereva 时间: 2021-1-15 06:06
你的使用格式明显不对，讲义上都有现成的例子
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如果你有讲义，好好仔细反复复习，绝对不可能看不懂。脚本里每个部分涉及的知识都在我的讲义上介绍得极为详细，没有任何超纲的内容，包括tcl的语法、各种命令的基本用法、条件判断、循环、atomselect的使用、VMD的内置各种命令（如上面脚本里用的measure）等等。

注意复习讲义
(, 下载次数 Times of downloads: 33)

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