计算化学公社

标题: 香豆素与6-甲基香豆素的弱相互作用分析求助 [打印本页]

作者
Author:
yyllxx    时间: 2021-1-16 22:18
标题: 香豆素与6-甲基香豆素的弱相互作用分析求助
本帖最后由 yyllxx 于 2021-1-17 11:11 编辑

我研究的课题是:太赫兹光谱研究物质:香豆素与6-甲基香豆素
本来打算通过“范德华势”+“静电势”一起分析弱相互作用,但遇到些问题。
首先通过能力分解分析(EDA-FF)预判分子间弱相互作用,结果如图一
静电势分析结果如预期,如图二所示
通过能力分解分析结果,选取5-7片段进行范德华势分析
问题一:但发现凡是范德华主导作用的片段都是π-π堆积,所以他们之间到底是范德华作用主导呢还是π-π堆积呢?看到卢天老师在色散校正博文中说到的一句话“一般说的范德华作用以及π-π堆积作用的本质都是色散作用”,所以我该如何建立π-π堆积作用与范德华势之间的关系呢?
问题二:在进行范德华势分析时,两个片段绘制等值面,蓝绿色是用来区别两个片段的,并不是用来区别正负值的,这样的范德华势分析有什么用呢?如图三所示,并没有表现出范德华作用呀
问题三:6-甲基香豆素单分子的范德华势中有正负值,但是香豆素单分子中只有正或负一种情况,能量分解分析中色散作用和交换互斥都有占比呀,为什么没体现出来呢?
希望各位老师同学帮我解答,十分感谢。


作者
Author:
sobereva    时间: 2021-1-17 05:37
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“弱相互作用分析”改了,以后务必注意

贴图的时候把图片按顺序插入,不要让图片以无序方式出现在帖子里,注意看置顶的新社员必读贴里关于贴图的说明。每个图片对应什么含义都说清楚,别让别人去猜

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-1-17 05:54
那叫能量分解不叫能力分解

1 pi-pi的本质就是近乎平行堆叠的pi共轭分子间的范德华作用中的色散吸引部分所致,仔细看此文了解更多相关知识
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html

2 先把图片序号标记清楚再说

3 等值面数值(isovalue)的选取严重影响你看到的等值面图像
色散作用不叫什么“色散校正”,完全是两个次元的概念
作者
Author:
yyllxx    时间: 2021-1-17 11:05
本帖最后由 yyllxx 于 2021-1-17 11:13 编辑
sobereva 发表于 2021-1-17 05:37
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

下次一定注意,谢谢老师!老师,图的顺序不知道咋挪,图一和图二的顺序反了

作者
Author:
yyllxx    时间: 2021-1-17 11:15
sobereva 发表于 2021-1-17 05:54
那叫能量分解不叫能力分解

1 pi-pi的本质就是近乎平行堆叠的pi共轭分子间的范德华作用中的色散吸引部分 ...

老师,图片标序说明了,色散校正也改为色散作用,为我的治学不严谨感到抱歉
麻烦您再次帮我解答,非常感谢呀!
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-1-22 14:06
2 范德华势本来就有正负号,“并不是用来区别正负值的” 这种描述等同于说一个片段的范德华势只有正值,这种描述显然是莫名其妙的。

一个分子浸在另一个分子的范德华势的等值面里,自然就已经说明了必然存在范德华作用。

搞清楚分子力场中分子间范德华作用的表达式,以及范德华势的定义思想,不可能想不明白。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3